26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1810 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  100 
 
 		 390 aa  734    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  54.74 
 
 		 394 aa  360  3e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 388 aa  256  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  50.66 
 
 		 378 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  48.61 
 
 		 388 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 402 aa  193  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 372 aa  180  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  28.12 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 512 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 512 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  30.95 
 
 		 454 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 512 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 457 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  32.54 
 
 		 465 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.06 
 
 		 486 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>