54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0175 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  793    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  36.96 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  35.93 
 
 		 394 aa  199  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 388 aa  163  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  33.12 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  30.61 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  26.71 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  25 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26.71 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3949  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0881757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4412  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 434 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  26.25 
 
 		 419 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  21.81 
 
 		 433 aa  47  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0463  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3206  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090157 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0349  transporter, major facilitator family  26.02 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0511  transporter, major facilitator family  26.02 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.905004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00379  hypothetical protein  26.02 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00375  predicted transporter  26.02 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3182  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.565255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  24.17 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0459  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0499  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32150  arabinose efflux permease family protein  26.73 
 
 		 467 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  25.12 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  27.55 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  21.76 
 
 		 445 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 405 aa  43.9  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  24.24 
 
 		 454 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  27.92 
 
 		 455 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18291  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  23.66 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  27.92 
 
 		 455 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>