More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4133 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  752    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  82.67 
 
 
413 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  80.94 
 
 
412 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  80.94 
 
 
412 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  60.61 
 
 
413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  59.42 
 
 
408 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  39.2 
 
 
417 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  42.3 
 
 
392 aa  208  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 
417 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  32.65 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  32.3 
 
 
433 aa  109  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1148  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 
420 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  29.97 
 
 
440 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  30.74 
 
 
421 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  30 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  30 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  32.59 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  29.89 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0788  major facilitator transporter  30.16 
 
 
453 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0336  major facilitator transporter  30.16 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0819  major facilitator transporter  30.16 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.138145  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  28.89 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  33.66 
 
 
388 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0717  major facilitator transporter  29.37 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231958  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0700  major facilitator transporter  29.63 
 
 
453 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  24.61 
 
 
439 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3897  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.99 
 
 
518 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  35.98 
 
 
517 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.1 
 
 
540 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4562  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
506 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.573494  normal  0.0249229 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1765  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.39 
 
 
413 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.236916  hitchhiker  0.00655505 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.33 
 
 
613 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3545  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 
490 aa  59.3  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.482074  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
506 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5673  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
506 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00952524 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  30.2 
 
 
388 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.24 
 
 
436 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  33.73 
 
 
481 aa  58.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  28.14 
 
 
582 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 
458 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25 
 
 
386 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 
521 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3580  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  26.92 
 
 
514 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  34.97 
 
 
400 aa  58.5  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  25.12 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
478 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
478 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3271  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.08 
 
 
411 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
478 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 
478 aa  57.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  28.3 
 
 
397 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
478 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0372  multidrug resistance protein  28.05 
 
 
528 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00361578  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2096  multidrug resistance protein  28.05 
 
 
528 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000633213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  27.27 
 
 
506 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  25.17 
 
 
478 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1918  major facilitator superfamily permease  28.05 
 
 
528 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00659527  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  28.48 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0813  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 
528 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000353321  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 
527 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 
517 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1831  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 
527 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  24.88 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
513 aa  57  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0461  multidrug resistance protein  28.05 
 
 
528 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0322246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0922  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 
528 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0612097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  24.41 
 
 
478 aa  57  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0721  multidrug resistance protein  28.05 
 
 
528 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165974  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0963  multidrug resistance protein D  28.28 
 
 
379 aa  57  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0211536  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0186  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 
528 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.69763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1018  multidrug resistance protein  28.05 
 
 
528 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0111689  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0460  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 
528 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1992  multidrug resistance protein  28.05 
 
 
528 aa  57  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000335607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1420  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 
528 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535165  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  28.3 
 
 
468 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  28.3 
 
 
468 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  28.04 
 
 
396 aa  56.6  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.46 
 
 
474 aa  56.2  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.48 
 
 
478 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 
520 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  29.7 
 
 
378 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.56 
 
 
587 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 
520 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  28.89 
 
 
553 aa  56.2  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
400 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 
520 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 
520 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.82 
 
 
520 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 
439 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 
504 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
505 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1875  multidrug resistance protein B  26.82 
 
 
360 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  24.54 
 
 
451 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.27 
 
 
458 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2516  major facilitator transporter  24.54 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>