126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2516 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2516  major facilitator transporter  100 
 
 		 354 aa  693    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.74 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2484  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  28.38 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  27.19 
 
 		 439 aa  55.5  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  32.64 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 405 aa  53.9  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 410 aa  53.5  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 455 aa  53.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2329  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 479 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371241  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  22.46 
 
 		 452 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  22.46 
 
 		 452 aa  52.8  0.000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 424 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0846  hypothetical protein  28.05 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.00000055342  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 443 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 416 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 413 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 444 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2356  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 453 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000435033  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  23.78 
 
 		 465 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.45 
 
 		 483 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  22.7 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 418 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0323  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  39.51 
 
 		 453 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  29.52 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  24.19 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 467 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 434 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2340  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 		 472 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 464 aa  47  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  29.17 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  27.34 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.36 
 
 		 456 aa  47  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  27.34 
 
 		 415 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  25 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2022  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 414 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0769  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 487 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.647722  normal  0.627018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 408 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  24.89 
 
 		 437 aa  46.2  0.0008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6564  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.91 
 
 		 526 aa  46.2  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.569718  normal  0.0165949 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  27.59 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.19 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2369  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 		 555 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.528601  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 383 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4140  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2104  major facilitator transporter  32.97 
 
 		 573 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 464 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 475 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  24.03 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0970  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 		 737 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1779  hypothetical protein  24.66 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1780  hypothetical protein  24.66 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  27.31 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.23 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  25 
 
 		 386 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  28 
 
 		 437 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  27.27 
 
 		 465 aa  44.3  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  27.59 
 
 		 426 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0437  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 453 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.630168 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 435 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3390  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 455 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 450 aa  44.3  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.82 
 
 		 458 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 442 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 464 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 440 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  25.5 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.16 
 
 		 478 aa  43.9  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.39 
 
 		 462 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 457 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2162  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0570  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 455 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000142598  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  24.23 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1015  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 523 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  29.7 
 
 		 413 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2578  major facilitator superfamily transporter  30.84 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148068 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3754  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 455 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000139158  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2050  MFS transport protein AraJ  28.57 
 
 		 405 aa  43.5  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 465 aa  43.5  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2198  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 481 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0460557  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2236  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.05 
 
 		 481 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.126562  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0555  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 455 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0580  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 455 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000944901  normal  0.0306529 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>