111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1846 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1846  major facilitator transporter  100 
 
 		 388 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0275429  normal  0.697868 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1613  major facilitator transporter  83.76 
 
 		 388 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0273655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2967  major facilitator transporter  82.8 
 
 		 378 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1810  putative major facilitator superfamily transport protein  49.72 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.521814  normal  0.460294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1097  major facilitator transporter  45.78 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1722  major facilitator transporter  38.13 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.36396  normal  0.2591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0175  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16310  putative MFS permease  32.58 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3847  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4521  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0504067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1721  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.309946  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1403  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4565  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.926259  normal  0.817996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1327  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 413 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3974  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280222 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3559  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.424378  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  27.59 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0744  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0364296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1378  multidrug resistance efflux transporter, putative  27.95 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.993613  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1567  multidrug resistance efflux transporter, putative  27.33 
 
 		 433 aa  53.5  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0274  multidrug ABC transporter  27.33 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.351648  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4133  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236743  normal  0.198961 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1565 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  29.34 
 
 		 1565 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0350  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 		 520 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.976424  normal  0.915508 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0171  drug resistance transporter,putative, EmrB/QacA subfamily  32.31 
 
 		 534 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 520 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3274  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 454 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.12 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.12 
 
 		 390 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  26.88 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  31.51 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  30.82 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.12 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  25.82 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  33.33 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1418  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.471824  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  34.4 
 
 		 440 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 429 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.95 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.65 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  25.82 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 527 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 527 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.82 
 
 		 390 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1277  major facilitator superfamily transporter  25.16 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1733  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 417 aa  47.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.14636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.31 
 
 		 526 aa  47  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0184  multidrug-efflux transporter  25.29 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000154899  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 453 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3785  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 462 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.0826493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.74 
 
 		 511 aa  46.6  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0259  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 449 aa  46.6  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  25 
 
 		 454 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  25.35 
 
 		 390 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 429 aa  46.2  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 539 aa  46.2  0.0009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1729  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1776  major facilitator superfamily transporter  38.27 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1708  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.841617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 384 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0529  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.25 
 
 		 543 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.794253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 516 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 420 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 472 aa  44.3  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.62 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3821  major facilitator superfamily transporter  32.05 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181358  normal  0.71225 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 512 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  25.57 
 
 		 454 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  33.68 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  35.16 
 
 		 526 aa  43.9  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 512 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  25.57 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  25.57 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  25.57 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  25.57 
 
 		 454 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 411 aa  43.9  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  32.17 
 
 		 464 aa  43.5  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0913  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.46 
 
 		 507 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.31457 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.46 
 
 		 507 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>