More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0795 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  84.8 
 
 		 253 aa  424  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.41 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  61.54 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  47.76 
 
 		 241 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  51.04 
 
 		 609 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  52.79 
 
 		 243 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  47.06 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  48.74 
 
 		 242 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  46.64 
 
 		 245 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  50.42 
 
 		 603 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  49.6 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  49.41 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  44.96 
 
 		 245 aa  212  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  44.58 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  49.36 
 
 		 242 aa  211  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  45.49 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  44.31 
 
 		 265 aa  210  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  44.31 
 
 		 264 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  51.3 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1599  ABC transporter related  45.53 
 
 		 239 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  43.57 
 
 		 245 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  47.48 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  44.18 
 
 		 255 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  44.4 
 
 		 277 aa  205  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  48.73 
 
 		 243 aa  205  7e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  47.06 
 
 		 244 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  47.9 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  45.45 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  46.72 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2282  ABC transporter related  48.32 
 
 		 239 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  46.91 
 
 		 616 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  42.63 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  44.77 
 
 		 242 aa  201  8e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1518  ABC transporter related  44.58 
 
 		 253 aa  201  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  42.91 
 
 		 270 aa  201  9e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2143  ABC transporter related  45.93 
 
 		 257 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  46.38 
 
 		 243 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1098  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.559592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 255 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  45.99 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  43.25 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1137  ABC transporter related  44.44 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.195731 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1893  ATPase  44.98 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0578772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  47.3 
 
 		 244 aa  198  7e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  43.2 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  44.35 
 
 		 259 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  45.87 
 
 		 246 aa  198  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  44.1 
 
 		 237 aa  198  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 		 254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1068  ABC transporter related  43.14 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.711539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  40.56 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  43.63 
 
 		 289 aa  196  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  42.57 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  43.78 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  43.63 
 
 		 289 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  43.39 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1394  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1196  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  49.38 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3409  ABC transporter related  43.55 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2707  ABC transporter related  43.55 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  50.63 
 
 		 238 aa  195  7e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  43.37 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  42.17 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3704  ABC transporter-like  42.4 
 
 		 260 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  43.35 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  40.16 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  41.04 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4794  ABC transporter related  45.97 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130359  normal  0.133792 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  45.53 
 
 		 241 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  42.57 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  44.98 
 
 		 257 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1384  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818364  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  44.26 
 
 		 239 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0732  ABC transporter related  46.28 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  43.65 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.11 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  42.64 
 
 		 302 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  40.94 
 
 		 257 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1481  ABC transporter related  45.82 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4306  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.32 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2774  ABC transporter-like protein protein  41.2 
 
 		 261 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  42.97 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  45.64 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0273  ABC transporter related  41.67 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197534  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  44.76 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  43.1 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50550  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.013767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  40.71 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1184  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  39.62 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00283179  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3094  ABC transporter related  41.34 
 
 		 660 aa  188  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  39.36 
 
 		 256 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  41.53 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1146  ABC transporter related  42.29 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  41.73 
 
 		 255 aa  188  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>