More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0771 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0771  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 661 aa  1316    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05097  sensor protein TorS  40.26 
 
 		 542 aa  264  4e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001231  methyl-accepting chemotaxis protein  43.34 
 
 		 542 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.554422  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  40.16 
 
 		 561 aa  253  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  40.23 
 
 		 558 aa  245  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  39.89 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0070  methyl-accepting chemotaxis protein  37.18 
 
 		 547 aa  228  4e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.740118  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0712  methyl-accepting chemotaxis citrate transducer  37.31 
 
 		 546 aa  223  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  36.36 
 
 		 543 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0170  methyl-accepting chemotaxis protein  35.45 
 
 		 543 aa  193  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2017  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.75882  hitchhiker  0.00000661881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.82 
 
 		 568 aa  189  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.08 
 
 		 549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 639 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  34.69 
 
 		 559 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1636  methyl-accepting chemotaxis protein  35.64 
 
 		 547 aa  181  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  34.17 
 
 		 712 aa  178  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  34.17 
 
 		 712 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  34.36 
 
 		 713 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  33.81 
 
 		 629 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  37.29 
 
 		 714 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.92 
 
 		 541 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.35 
 
 		 640 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.07 
 
 		 650 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0160  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.98 
 
 		 653 aa  173  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 		 633 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 		 716 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1249  methyl-accepting chemotaxis protein  33.43 
 
 		 596 aa  171  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000483868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 		 773 aa  172  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  37.01 
 
 		 714 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.36 
 
 		 543 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.85 
 
 		 636 aa  171  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 		 558 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.09 
 
 		 640 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.45 
 
 		 573 aa  170  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.02936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.64 
 
 		 573 aa  170  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.5 
 
 		 499 aa  169  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 653 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 634 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.85 
 
 		 632 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 647 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 		 714 aa  167  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  34.37 
 
 		 545 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.65 
 
 		 638 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 541 aa  167  8e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2234  putative chemotaxis transducer  35.6 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0410  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.91 
 
 		 538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.22 
 
 		 688 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  31.27 
 
 		 533 aa  165  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  32.79 
 
 		 630 aa  165  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2511  methyl-accepting chemotaxis protein  33.06 
 
 		 653 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295069  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0207  methyl-accepting chemotaxis protein  31.95 
 
 		 666 aa  165  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.152775  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.41 
 
 		 714 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  35.77 
 
 		 714 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.1 
 
 		 564 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1793  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.04 
 
 		 533 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0175347  normal  0.776493 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.2 
 
 		 522 aa  164  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.04 
 
 		 533 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0922  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.28 
 
 		 572 aa  164  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.981358 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 640 aa  163  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 		 638 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 674 aa  163  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.11 
 
 		 619 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  33.51 
 
 		 715 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 639 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 630 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 		 630 aa  162  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.78 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.91 
 
 		 547 aa  162  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.02 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  33.43 
 
 		 543 aa  162  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.85 
 
 		 688 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.04 
 
 		 739 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.52 
 
 		 646 aa  160  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 		 557 aa  160  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 		 630 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 		 630 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 		 630 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.25 
 
 		 630 aa  160  7e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 		 639 aa  160  8e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.53 
 
 		 714 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.62 
 
 		 640 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.72 
 
 		 630 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.21 
 
 		 548 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 		 688 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  30.98 
 
 		 546 aa  159  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.92 
 
 		 647 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.42 
 
 		 688 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.18 
 
 		 540 aa  158  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 630 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  33.89 
 
 		 628 aa  158  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.63 
 
 		 626 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.77 
 
 		 547 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.14 
 
 		 630 aa  158  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  31.44 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.18 
 
 		 544 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 636 aa  158  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>