230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1444 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0899    99.86 
 
 		 2612 bp  2839    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0358    99.86 
 
 		 2834 bp  2837    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1000    99.86 
 
 		 2927 bp  2837    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1429    99.86 
 
 		 3692 bp  2839    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.367777  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1444    100 
 
 		 3459 bp  6857    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2852    99.93 
 
 		 2204 bp  2847    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  83.33 
 
 		 1893 bp  107  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03602    88.04 
 
 		 1626 bp  95.6  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  83.1 
 
 		 1887 bp  91.7  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.48 
 
 		 1623 bp  87.7  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.21 
 
 		 1575 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3046    87.21 
 
 		 969 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  82.84 
 
 		 1887 bp  83.8  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1601  chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 1503 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.78336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3725  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  87.21 
 
 		 1575 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4136  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.29 
 
 		 1983 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.29 
 
 		 1983 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.751262  normal  0.782794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.21 
 
 		 1575 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.29 
 
 		 1983 bp  83.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03783  Methyl-accepting chemotaxis protein (PAS/PAC and MSP doamins)  85.87 
 
 		 1584 bp  79.8  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  85.71 
 
 		 1926 bp  77.8  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3396    85.26 
 
 		 1446 bp  77.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.34 
 
 		 1575 bp  77.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0341  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.31 
 
 		 1635 bp  75.8  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  86.05 
 
 		 2019 bp  75.8  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03417  methyl-accepting chemotaxis protein  86.05 
 
 		 2025 bp  75.8  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.617562  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004004  methyl-accepting chemotaxis protein  84.69 
 
 		 1992 bp  75.8  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05406  histidine kinase/response regulator hybrid protein  87.01 
 
 		 2001 bp  73.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001468  methyl-accepting chemotaxis protein  87.01 
 
 		 2001 bp  73.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.01 
 
 		 1893 bp  73.8  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397129 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  85.39 
 
 		 1620 bp  73.8  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.61 
 
 		 1911 bp  73.8  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.16 
 
 		 1581 bp  73.8  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.65 
 
 		 1893 bp  71.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.25 
 
 		 1569 bp  71.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1016  methyl-accepting chemotaxis protein  84.21 
 
 		 1692 bp  69.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02244  hypothetical protein  85.54 
 
 		 2019 bp  69.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1215  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  87.32 
 
 		 2037 bp  69.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.06 
 
 		 1887 bp  69.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00619864  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  84.88 
 
 		 2004 bp  67.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3010  chemotaxis sensory transducer  84.44 
 
 		 1620 bp  67.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.88 
 
 		 2025 bp  67.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0583  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  88.71 
 
 		 1575 bp  67.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.344402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3447  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  88.71 
 
 		 1575 bp  67.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0524  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.67 
 
 		 1620 bp  67.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002906  methyl-accepting chemotaxis protein  86.49 
 
 		 2037 bp  67.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.816112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02368  hypothetical protein  84.88 
 
 		 1419 bp  67.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 		 1089 bp  67.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.67 
 
 		 1872 bp  67.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000502  methyl-accepting chemotaxis protein  84.27 
 
 		 1770 bp  65.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.567249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3838  methyl-accepting chemotaxis protein  85.71 
 
 		 1863 bp  65.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02788  hypothetical protein  84.27 
 
 		 2097 bp  65.9  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.71 
 
 		 1596 bp  65.9  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2659  methyl-accepting chemotaxis protein  84.27 
 
 		 1671 bp  65.9  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0861  chemotaxis sensory transducer  90.57 
 
 		 1446 bp  65.9  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  84.27 
 
 		 1677 bp  65.9  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.87 
 
 		 1977 bp  65.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0632  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  87.69 
 
 		 1299 bp  65.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152776  normal  0.082918 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0685  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.27 
 
 		 1863 bp  65.9  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  83.7 
 
 		 1737 bp  63.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2432  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.29 
 
 		 1668 bp  63.9  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0013651  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  85 
 
 		 1602 bp  63.9  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0570  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.7 
 
 		 2025 bp  63.9  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.7 
 
 		 1644 bp  63.9  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0441023  normal  0.46066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3551  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85 
 
 		 1863 bp  63.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1387  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.52 
 
 		 2004 bp  63.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2239  chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 		 1947 bp  63.9  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.56 
 
 		 1893 bp  63.9  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1436  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 		 1740 bp  63.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05646  histidine kinase  86.76 
 
 		 1449 bp  63.9  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.33 
 
 		 1740 bp  63.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.7 
 
 		 2022 bp  63.9  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0582  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  83.7 
 
 		 1575 bp  63.9  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0691  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85 
 
 		 1863 bp  63.9  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2530  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  85.53 
 
 		 1602 bp  63.9  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.616311  hitchhiker  0.00580613 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1754    85.53 
 
 		 1602 bp  63.9  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0916  methyl-accepting chemotaxis protein  83.33 
 
 		 1632 bp  63.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  80.56 
 
 		 1893 bp  63.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  82.69 
 
 		 1902 bp  63.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002443  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  82.83 
 
 		 1626 bp  61.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000057049  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0262  chemotaxis sensory transducer  86.57 
 
 		 1953 bp  61.9  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.57 
 
 		 1674 bp  61.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  88.14 
 
 		 1626 bp  61.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1503  methyl-accepting chemotaxis protein III  89.09 
 
 		 1641 bp  61.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0397  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  86.57 
 
 		 1314 bp  61.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.16 
 
 		 1647 bp  61.9  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.92 
 
 		 1956 bp  61.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  84.34 
 
 		 1632 bp  61.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2026  methyl-accepting chemotaxis protein III  89.09 
 
 		 1413 bp  61.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000214401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0270  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.92 
 
 		 1956 bp  61.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1600  methyl-accepting chemotaxis protein III  89.09 
 
 		 1641 bp  61.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  84.81 
 
 		 2088 bp  61.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.92 
 
 		 1659 bp  61.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.92 
 
 		 1956 bp  61.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  85.92 
 
 		 2004 bp  61.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  88.14 
 
 		 1632 bp  61.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2936  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  83.16 
 
 		 1089 bp  61.9  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  83.91 
 
 		 2313 bp  61.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2238  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  89.09 
 
 		 1641 bp  61.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  82.83 
 
 		 1932 bp  61.9  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>