More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001468 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001468  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 666 aa  1338    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05406  histidine kinase/response regulator hybrid protein  99.1 
 
 		 666 aa  1325    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0529  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  29.46 
 
 		 677 aa  236  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.96 
 
 		 671 aa  196  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0534  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  26.38 
 
 		 733 aa  177  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.627871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 		 668 aa  174  5.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  37.7 
 
 		 541 aa  170  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  32.29 
 
 		 628 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02691  hypothetical protein  34.6 
 
 		 535 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.63 
 
 		 541 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 		 541 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.15 
 
 		 543 aa  163  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.96 
 
 		 707 aa  162  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.41 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.58 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0570  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.73 
 
 		 674 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 		 564 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000139892  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1249  methyl-accepting chemotaxis protein  29.86 
 
 		 596 aa  161  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000483868  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  33.84 
 
 		 628 aa  160  6e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  31.28 
 
 		 541 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2891  chemotaxis sensory transducer  30.02 
 
 		 673 aa  160  8e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.63 
 
 		 541 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.21 
 
 		 547 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.91 
 
 		 541 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  29.87 
 
 		 544 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 620 aa  158  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.91 
 
 		 541 aa  159  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  33.42 
 
 		 672 aa  158  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.88 
 
 		 560 aa  158  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  31.32 
 
 		 638 aa  158  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.75 
 
 		 543 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  32.36 
 
 		 628 aa  157  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.12 
 
 		 544 aa  157  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.61 
 
 		 638 aa  157  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.46 
 
 		 544 aa  157  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 554 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  35.91 
 
 		 541 aa  156  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.87 
 
 		 658 aa  157  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.88 
 
 		 632 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.25 
 
 		 675 aa  156  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.547128  hitchhiker  0.00024543 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 		 533 aa  156  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 638 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4557  methyl-accepting chemotaxis protein  31.84 
 
 		 623 aa  155  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  30.87 
 
 		 658 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 		 570 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.44 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.44 
 
 		 554 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.87 
 
 		 637 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.6 
 
 		 638 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.83 
 
 		 623 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3950  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.83 
 
 		 623 aa  154  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.75 
 
 		 630 aa  154  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.83 
 
 		 623 aa  154  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4964  methyl-accepting chemotaxis protein  36.06 
 
 		 545 aa  154  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.83 
 
 		 623 aa  154  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.08 
 
 		 636 aa  154  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 555 aa  154  7e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.85 
 
 		 533 aa  153  8e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 636 aa  153  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  32.42 
 
 		 642 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 		 525 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.24 
 
 		 544 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  34.33 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0252  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.51 
 
 		 623 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.866394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.75 
 
 		 650 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.9 
 
 		 658 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4057  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.28 
 
 		 537 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 623 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 658 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.04 
 
 		 544 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.33 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.12 
 
 		 598 aa  152  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  30.75 
 
 		 695 aa  152  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.33 
 
 		 623 aa  152  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.438395  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.84 
 
 		 539 aa  152  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  31.35 
 
 		 541 aa  152  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 		 541 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  34.41 
 
 		 647 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.35 
 
 		 520 aa  151  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000607785  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0193  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 		 623 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.63 
 
 		 546 aa  151  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 554 aa  150  5e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.62 
 
 		 539 aa  151  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0194  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.01 
 
 		 623 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.01 
 
 		 623 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4141  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.01 
 
 		 623 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  32.65 
 
 		 701 aa  150  6e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  29.01 
 
 		 546 aa  150  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 642 aa  150  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  28.8 
 
 		 645 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.17 
 
 		 640 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  30.96 
 
 		 639 aa  150  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.97 
 
 		 544 aa  150  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.445183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.95 
 
 		 540 aa  150  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.65 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001368  methyl-accepting chemotaxis protein  32.24 
 
 		 519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237865  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.77 
 
 		 636 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>