More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1353 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3722  acriflavin resistance protein  52.3 
 
 		 1029 aa  1077    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  100 
 
 		 1025 aa  2087    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  48.82 
 
 		 1020 aa  1003    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3642  acriflavin resistance protein  49.65 
 
 		 1028 aa  957    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2714  acriflavin resistance protein  44.54 
 
 		 1017 aa  829    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.465626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  51.33 
 
 		 1041 aa  1056    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0663  acriflavin resistance protein  52.4 
 
 		 1029 aa  1078    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  57.34 
 
 		 1019 aa  1206    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3213  putative efflux protein  36.48 
 
 		 1027 aa  671    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3993  AcrB/AcrD/AcrF family metabolite exporter  51.52 
 
 		 1025 aa  1066    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  81.91 
 
 		 1036 aa  1716    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1716  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.53 
 
 		 1014 aa  798    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.415389  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  39.12 
 
 		 1012 aa  684    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3849  acriflavin resistance protein  47.19 
 
 		 1009 aa  942    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.771942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  42.21 
 
 		 1013 aa  803    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1419  acriflavin resistance protein  47.94 
 
 		 1016 aa  964    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3696  acriflavin resistance protein  53.44 
 
 		 1025 aa  1106    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.42345  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1612  acriflavin resistance protein  44.13 
 
 		 1040 aa  925    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  52.02 
 
 		 1010 aa  1067    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0057  acriflavin resistance protein  46.58 
 
 		 1019 aa  913    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.663476  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0696  acriflavin resistance protein  53.04 
 
 		 1027 aa  1070    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.627027  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0466  acriflavin resistance protein  52.75 
 
 		 1024 aa  1103    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0675  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  59.16 
 
 		 1028 aa  1253    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3572  acriflavin resistance protein  53.09 
 
 		 1027 aa  1084    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17403  normal  0.560484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  81.51 
 
 		 1036 aa  1710    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000655  transporter AcrB/D/F family  36.29 
 
 		 1020 aa  659    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.955615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3512  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  49.65 
 
 		 1028 aa  957    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.270807  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  57.58 
 
 		 1023 aa  1207    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0848  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  49.55 
 
 		 1028 aa  955    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.377805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4315  acriflavin resistance protein  52.65 
 
 		 1028 aa  1106    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  82.16 
 
 		 1032 aa  1714    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0631  acriflavin resistance protein  42.48 
 
 		 1016 aa  785    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.140124  normal  0.0944668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1915  acriflavin resistance protein  45.65 
 
 		 1056 aa  922    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02665  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42 
 
 		 1013 aa  793    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2869  acriflavin resistance protein  57.17 
 
 		 1024 aa  1208    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00922852  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  57.28 
 
 		 1019 aa  1218    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1917  acriflavin resistance protein  36.09 
 
 		 1035 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.261287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02530  acriflavin resistance protein ei VT8  48.22 
 
 		 1015 aa  1010    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.461741  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1262  acriflavin resistance protein  42.24 
 
 		 1017 aa  786    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0594234  normal  0.65985 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2777  acriflavin resistance protein  41.57 
 
 		 1014 aa  783    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.229132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  36.38 
 
 		 1035 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3402  acriflavin resistance protein  53.18 
 
 		 1029 aa  1085    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.33342  hitchhiker  0.00241288 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0550  acriflavin resistance protein  53.18 
 
 		 1029 aa  1087    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1355  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  42.95 
 
 		 1016 aa  855    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000701931  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2116  acriflavin resistance protein  36.38 
 
 		 1035 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0119534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  39.88 
 
 		 1013 aa  762    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1436  acriflavin resistance protein  52.25 
 
 		 1021 aa  1087    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3665  acriflavin resistance protein  56.32 
 
 		 1029 aa  1145    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  72.62 
 
 		 1021 aa  1561    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2116  acriflavin resistance protein  43.39 
 
 		 1043 aa  831    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0667  acriflavin resistance protein  52.69 
 
 		 1029 aa  1074    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0629  acriflavin resistance protein  53.05 
 
 		 1028 aa  1119    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0640  acriflavin resistance protein  52.4 
 
 		 1029 aa  1076    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  35.06 
 
 		 1019 aa  603  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  32.69 
 
 		 1039 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1039 aa  599  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.58 
 
 		 1027 aa  597  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2827  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 		 1053 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0321922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  31.69 
 
 		 1046 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1041 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  32.94 
 
 		 1036 aa  592  1e-168  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  33.82 
 
 		 1041 aa  591  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2959  acriflavin resistance protein  32.98 
 
 		 1071 aa  589  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00263635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1044 aa  589  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2028  acriflavin resistance protein  32.95 
 
 		 1089 aa  588  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.393599  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  32.3 
 
 		 1025 aa  588  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  32.27 
 
 		 1039 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  32.72 
 
 		 1049 aa  585  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3761  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1047 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.29513 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  32.62 
 
 		 1049 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 		 1046 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 		 1036 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  32.3 
 
 		 1025 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  33.6 
 
 		 1025 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  32.27 
 
 		 1051 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1024 aa  581  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  33.56 
 
 		 1019 aa  581  1e-164  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  32.94 
 
 		 1046 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1067 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1046 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5089  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1023 aa  576  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0880645  normal  0.0178395 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1045 aa  575  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  32.78 
 
 		 1021 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  32.59 
 
 		 1021 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1031 aa  568  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  32.49 
 
 		 1021 aa  569  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  33.01 
 
 		 1054 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  32.46 
 
 		 1022 aa  567  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1552  acriflavin resistance protein  32.91 
 
 		 1060 aa  568  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1753  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1048 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0236  RND efflux transporter  31.8 
 
 		 1015 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  31.67 
 
 		 1015 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1019 aa  561  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  31.04 
 
 		 1047 aa  560  1e-158  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5369  acriflavin resistance protein  31.93 
 
 		 1023 aa  562  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.575486 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  32.42 
 
 		 1021 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2533  acriflavin resistance protein  32.67 
 
 		 1067 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1661  acriflavin resistance protein  32.26 
 
 		 1047 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1661  acriflavin resistance protein  32.17 
 
 		 1047 aa  561  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302634  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1740  acriflavin resistance protein  31.89 
 
 		 1049 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>