More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003529 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003529  outer membrane protein  100 
 
 		 272 aa  563  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02232  hypothetical protein  85.61 
 
 		 284 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0311  outer membrane protein, OmpA family  57.6 
 
 		 275 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.99 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  40.4 
 
 		 429 aa  82  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.74 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  34.26 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0163  OmpA/MotB domain protein  40.18 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  34.92 
 
 		 1026 aa  79  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.45 
 
 		 427 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  42 
 
 		 352 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  36.89 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  36.19 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2517  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0742352  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  37.25 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0606  OmpA/MotB domain-containing protein  38.74 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0759282 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10923  OmpA family protein  37.14 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.497163  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  38.94 
 
 		 345 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  36.21 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  34.69 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  31.68 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  34.95 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3096  OmpA family protein  35.4 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.625816  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  35.09 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  32.41 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.37 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0366  OmpA/MotB domain-containing protein  35.59 
 
 		 359 aa  73.6  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.193162  normal  0.220878 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  31.75 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  31.75 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1033  OmpA family protein  38.84 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.383964  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  35.48 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2694  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.110946 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  34.26 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0195  OmpA/MotB domain-containing protein  38.66 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  36.28 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0386  outer membrane fibronectin-binding protein  33.02 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  36.36 
 
 		 447 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  38.46 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  35.65 
 
 		 344 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.65 
 
 		 344 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  33.09 
 
 		 286 aa  72  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  38.38 
 
 		 457 aa  72  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  35.65 
 
 		 344 aa  72  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5036  ompA family protein  36.27 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2405  OmpA/MotB domain protein  34.95 
 
 		 175 aa  71.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.741795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  35.65 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  29.68 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  36.36 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2123  OmpA/MotB domain-containing protein  36.97 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0746803  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1624  OmpA/MotB domain-containing protein  27.81 
 
 		 255 aa  72  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0548574  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  36.54 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  31.01 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  36.89 
 
 		 169 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.29 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.14 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  34.51 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3025  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.970815  normal  0.30495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  35.65 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  37.38 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01611  hypothetical protein  38.54 
 
 		 173 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 486 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  41 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  36.19 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  34.78 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.7 
 
 		 623 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.78 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  37.14 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0100  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  37.5 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.949654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.13 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  35.24 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2166  outer membrane protein  34.75 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000706819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  32.69 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  35.35 
 
 		 454 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2875  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  38.24 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  31.71 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  37.37 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.36 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  35.29 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 459 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2004  OmpA family protein  27.33 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 490 aa  68.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  37.38 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  34.91 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1267  OmpA/MotB  35.65 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>