More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002648 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  100 
 
 		 402 aa  817    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2018  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.96 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.724066  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  27.41 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  27.14 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  25.83 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2367  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.37 
 
 		 418 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.129539  normal  0.0992977 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  23.7 
 
 		 392 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.5 
 
 		 398 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  25.37 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  25.63 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.77 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  29.37 
 
 		 412 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  25 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  25.78 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  25.33 
 
 		 400 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 373 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  25.07 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  25.36 
 
 		 376 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  24.08 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  26.79 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.91 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  24.93 
 
 		 399 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  27.3 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.69 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  23.84 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.16 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.65 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.6 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  26.8 
 
 		 407 aa  94  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.48 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.1 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  23.62 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  21.63 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  23.53 
 
 		 402 aa  88.6  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3655  pilus assembly protein  22.51 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  22.82 
 
 		 444 aa  87  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  21.33 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  23.69 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  23.69 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  23.69 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  24.33 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  23.67 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2568  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  23.39 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133451  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  23.65 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  23.65 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  23.08 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.61 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  28.33 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  21.69 
 
 		 580 aa  81.3  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  24.06 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2490  Septum formation inhibitor-activating ATPase- like protein  26.05 
 
 		 416 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000737443 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0847  hypothetical protein  22.74 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4662  response regulator receiver domain-containing protein  23.98 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0132095  hitchhiker  0.00330156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  19.09 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.22 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  24.91 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  23.75 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0552  septum site-determining protein MinD  26.1 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  21.98 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1498  response regulator receiver protein  24.49 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259405  hitchhiker  0.00000329057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2019  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  21.82 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1042  response regulator receiver protein  24.49 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.497148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1522  response regulator receiver protein  24.49 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  20.72 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  22.26 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  23.13 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  22.63 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  20.88 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  24.18 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6001  response regulator receiver protein  23.99 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.188719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4392  pilus assembly protein CpaE  19.68 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  19.87 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1353  septum site-determining protein MinD  26.84 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6297  response regulator receiver protein  23.99 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5410  pilus assembly protein  20.91 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.215437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  20.78 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3354  response regulator receiver protein  20.42 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  23.57 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0647  pilus assembly protein CpaE  21.07 
 
 		 396 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1731  response regulator receiver protein  21.67 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000047972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4190  response regulator receiver protein  21.71 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1404  response regulator receiver protein  24.41 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4852  hypothetical protein  19.68 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  23.43 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  23.43 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  23.43 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2055  response regulator receiver domain-containing protein  20 
 
 		 415 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00464335  normal  0.104531 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  28.33 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  23.78 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  23.43 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  23.43 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  23.43 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1641  pilus assembly protein CpaE  23.33 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00628351  normal  0.327088 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1436  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.48 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  23.43 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>