More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1556 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 189 aa  381  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 136 aa  90.9  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  29.61 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3915  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263248  normal  0.0186939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 173 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 157 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12730  transcriptional regulator  30.47 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330444  normal  0.769742 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  33.72 
 
 		 149 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2662  transcriptional regulator, MarR family  39.76 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.800097  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0968  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  40.82 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  24.43 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.44 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.44 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.44 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.44 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  28.44 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  21.32 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  29.8 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.52 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.52 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.52 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.52 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.52 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.52 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  27.52 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  27.52 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3128  regulatory protein, MarR  33.8 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.537858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  28.66 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4036  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 140 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36750  transcriptional regulator  27.91 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49551  normal  0.235126 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15440  MarR family regulator  53.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00511304  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  28.43 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  35.63 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  35.63 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.69 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0223  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 164 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.701227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0533  MarR family transcriptional regulator  25.34 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0199  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  33.72 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  32.95 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  30.21 
 
 		 148 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  23.64 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3355  MarR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.496446  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  30.3 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 157 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0684  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 148 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.12 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 137 aa  52.8  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>