More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1284 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  100 
 
 
147 aa  300  6.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  66.67 
 
 
147 aa  206  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1299  UspA domain protein  54.42 
 
 
144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0196706  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1233  UspA domain protein  54.42 
 
 
144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.997743  normal  0.558302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1359  hypothetical protein  54.42 
 
 
168 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 
144 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  52.38 
 
 
144 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  53.06 
 
 
144 aa  152  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  52.38 
 
 
144 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  52.38 
 
 
144 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  52.38 
 
 
144 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  52.38 
 
 
144 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  52.38 
 
 
144 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  52.38 
 
 
144 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  52.38 
 
 
144 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  51.7 
 
 
144 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  51.7 
 
 
144 aa  151  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  50.34 
 
 
144 aa  148  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  51.02 
 
 
144 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  50.34 
 
 
144 aa  146  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  50.34 
 
 
145 aa  141  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2068  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 
144 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.960208  normal  0.914393 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6028  hypothetical protein  53.06 
 
 
144 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.999121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2049  UspA domain-containing protein  53.06 
 
 
144 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.765605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  47.62 
 
 
144 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2487  UspA domain protein  46.94 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0465125  hitchhiker  0.000264577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  47.3 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2059  UspA domain protein  47.62 
 
 
156 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3944  hitchhiker  0.00218931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  48.3 
 
 
144 aa  134  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  47.26 
 
 
145 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  47.62 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2637  hypothetical protein  46.26 
 
 
144 aa  121  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163827  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4660  putative universal stress protein (Usp)  44.08 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.969367  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1519  UspA domain-containing protein  41.78 
 
 
148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0716802  normal  0.348047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1173  UspA domain-containing protein  42.18 
 
 
147 aa  117  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.761945  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  45.58 
 
 
143 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0997  UspA domain protein  42.86 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1081  UspA domain-containing protein  42.86 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952859  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0788  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.523142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1926  hypothetical protein  42.86 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4308  hypothetical protein  41.5 
 
 
147 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00896563  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  43.92 
 
 
147 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4213  UspA domain protein  40.54 
 
 
146 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.501381  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4323  UspA domain protein  40.54 
 
 
146 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.729204  normal  0.0224521 
 
 
-
 
NC_003296  RS05426  hypothetical protein  41.89 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2230  UspA domain-containing protein  44.9 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0395018 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3206  UspA domain protein  43.54 
 
 
151 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  38.67 
 
 
149 aa  105  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2772  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
147 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  44.65 
 
 
148 aa  104  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  37.93 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1892  universal stress protein  40 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0327911  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1966  universal stress protein  40 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0463  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  39.22 
 
 
144 aa  90.5  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 
145 aa  90.1  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4356  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244024  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1352  UspA domain protein  37.93 
 
 
146 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.012903 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1821  UspA domain-containing protein  36.73 
 
 
147 aa  89.4  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  37.59 
 
 
181 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2683  universal stress protein UspA  39.6 
 
 
148 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  36.73 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1055  universal stress protein  37.33 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  36.42 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3875  hypothetical protein  40.54 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0994  universal stress protein  37.33 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3490  universal stress protein  40 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.267161  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1929  UspA domain-containing protein  42.95 
 
 
146 aa  84  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1732  UspA domain protein  42.95 
 
 
146 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3943  UspA domain protein  31.76 
 
 
148 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0249  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00974086 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  39.86 
 
 
147 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  35.37 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  31.79 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  36 
 
 
155 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  38.93 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3154  UspA domain-containing protein  39.55 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.759591  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1409  UspA domain protein  36.3 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.554815 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1529  UspA domain protein  34.01 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  31.13 
 
 
156 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0644  UspA domain-containing protein  43.54 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.577691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  37.42 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0943  UspA domain protein  34.39 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0887098  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  31.41 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  33.77 
 
 
276 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.86 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.29 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  35.71 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  35.76 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  33.76 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  31.51 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.14 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  34.44 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0624  UspA domain-containing protein  34.21 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.11 
 
 
154 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 
142 aa  70.1  0.000000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  31.76 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3368  hypothetical protein  33.55 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>