62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0916 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  100 
 
 
188 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2368  peptidase C60 sortase A and B  55.1 
 
 
212 aa  166  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00022706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  52.41 
 
 
298 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  50.69 
 
 
368 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1052  hypothetical protein  48.03 
 
 
291 aa  161  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236232  hitchhiker  0.00758039 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  53.29 
 
 
225 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  52.63 
 
 
223 aa  154  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  53.7 
 
 
309 aa  153  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  50.91 
 
 
192 aa  153  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  42.86 
 
 
284 aa  146  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1719  peptidase C60 sortase A and B  48 
 
 
203 aa  143  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724245  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3534  peptidase C60, sortase A and B  50.66 
 
 
279 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  51.68 
 
 
216 aa  141  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5005  peptidase C60 sortase A and B  50.7 
 
 
347 aa  141  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.387743  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3909  peptidase C60 sortase A and B  49.66 
 
 
279 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.985373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1145  hypothetical protein  41.58 
 
 
187 aa  137  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.895027  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  51.37 
 
 
214 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8256  peptidase C60 sortase A and B  47.8 
 
 
242 aa  136  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  50 
 
 
210 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0613  peptidase C60 sortase A and B  43.43 
 
 
178 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.405747  normal  0.507985 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1734  peptidase C60, sortase A and B  48.28 
 
 
214 aa  134  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.841121 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3164  peptidase C60 sortase A and B  45.03 
 
 
208 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  hitchhiker  0.0000126147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3186  peptidase C60 sortase A and B  44.37 
 
 
245 aa  131  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0385448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2482  peptidase C60 sortase A and B  53.74 
 
 
196 aa  131  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  49.66 
 
 
167 aa  131  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3574  peptidase C60 sortase A and B  45.77 
 
 
247 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3978  peptidase C60 sortase A and B  45.77 
 
 
247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107893  normal  0.372748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7838  peptidase C60 sortase A and B  47.06 
 
 
946 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0706316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  50.69 
 
 
276 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  42.77 
 
 
235 aa  127  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6891  hypothetical protein  47.62 
 
 
235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13180  sortase (surface protein transpeptidase)  42.31 
 
 
213 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.422261  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0157  peptidase C60 sortase A and B  48.68 
 
 
235 aa  117  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  38.73 
 
 
321 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  45.39 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  43.75 
 
 
267 aa  104  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0141  peptidase C60, sortase A and B  43.15 
 
 
241 aa  95.5  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0474  peptidase C60 sortase A and B  38.97 
 
 
222 aa  90.1  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  38.96 
 
 
220 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4732  peptidase C60 sortase A and B  38.04 
 
 
202 aa  84.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4206  peptidase C60, sortase A and B  39.19 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09850  sortase (surface protein transpeptidase)  36.55 
 
 
144 aa  79.3  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.618908  normal  0.0802521 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3472  peptidase C60 sortase A and B  32.43 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0221  peptidase C60, sortase A and B  32.48 
 
 
238 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  35.61 
 
 
384 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2061  peptidase C60 sortase A and B  34.87 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.244992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0373  peptidase C60 sortase A and B  31.94 
 
 
243 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642022 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  36.5 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  32.33 
 
 
248 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  34.33 
 
 
375 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  33.85 
 
 
238 aa  55.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  34.31 
 
 
244 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  33.33 
 
 
235 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1772  peptidase C60 sortase A and B  29.94 
 
 
228 aa  50.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  31.36 
 
 
238 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  29.6 
 
 
260 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  32.06 
 
 
302 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0695  peptidase C60 sortase A and B  31.13 
 
 
228 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13700  sortase (surface protein transpeptidase)  32.82 
 
 
226 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  33.82 
 
 
251 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2595  peptidase C60, sortase A and B  34.21 
 
 
213 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10380  hypothetical protein  30.23 
 
 
282 aa  41.6  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0366164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>