More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0523 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  45.79 
 
 		 1144 aa  758    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  43.48 
 
 		 1134 aa  701    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  47.93 
 
 		 1096 aa  760    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  58.91 
 
 		 1074 aa  1062    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 1044 aa  2063    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  49.07 
 
 		 1062 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  59.01 
 
 		 1059 aa  1115    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  46.52 
 
 		 1050 aa  728    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  59.01 
 
 		 1051 aa  1113    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.02 
 
 		 1066 aa  689    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  42.32 
 
 		 1135 aa  636    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  43.86 
 
 		 1040 aa  699    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  44.58 
 
 		 1095 aa  682    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  44.76 
 
 		 1060 aa  657    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  67.04 
 
 		 1060 aa  1347    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  43.51 
 
 		 1103 aa  592  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  43.52 
 
 		 1098 aa  580  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  39.14 
 
 		 1055 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  38.14 
 
 		 1038 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  40.6 
 
 		 1099 aa  533  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  38.58 
 
 		 1051 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  38.58 
 
 		 1051 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  37.47 
 
 		 1129 aa  526  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  37.31 
 
 		 1038 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  37.56 
 
 		 1051 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  38.33 
 
 		 1076 aa  508  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  37.01 
 
 		 1115 aa  489  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  36.72 
 
 		 1094 aa  478  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  36.31 
 
 		 1150 aa  446  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  33.24 
 
 		 1059 aa  433  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.32 
 
 		 1145 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  35.97 
 
 		 1085 aa  385  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.39 
 
 		 1124 aa  376  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.01 
 
 		 1083 aa  371  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  37.6 
 
 		 1197 aa  349  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.52 
 
 		 1058 aa  329  1.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 946 aa  221  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  25.08 
 
 		 946 aa  221  6e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  24.67 
 
 		 666 aa  188  6e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 724 aa  187  8e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 1019 aa  185  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 731 aa  184  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 		 707 aa  176  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  31.23 
 
 		 1124 aa  174  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.27 
 
 		 745 aa  174  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  32.31 
 
 		 1162 aa  172  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.25 
 
 		 785 aa  172  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  26.09 
 
 		 689 aa  170  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 1073 aa  170  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.01 
 
 		 743 aa  170  2e-40  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  25.24 
 
 		 655 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 		 735 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  30.37 
 
 		 1128 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.37 
 
 		 671 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 678 aa  165  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 678 aa  166  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.21 
 
 		 1111 aa  165  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  29.58 
 
 		 671 aa  164  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  27.98 
 
 		 706 aa  164  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.01 
 
 		 739 aa  164  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  29.44 
 
 		 671 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  29.36 
 
 		 1108 aa  162  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 762 aa  162  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  30.59 
 
 		 797 aa  160  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  31.76 
 
 		 1162 aa  160  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 		 741 aa  160  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.03 
 
 		 747 aa  160  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.63 
 
 		 762 aa  159  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.43 
 
 		 742 aa  159  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.11 
 
 		 753 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.79 
 
 		 763 aa  159  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.11 
 
 		 753 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  28.77 
 
 		 688 aa  159  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.79 
 
 		 729 aa  158  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 		 678 aa  158  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  25.07 
 
 		 706 aa  158  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  28.61 
 
 		 743 aa  158  5.0000000000000005e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.83 
 
 		 741 aa  158  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.01 
 
 		 729 aa  157  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.39 
 
 		 747 aa  157  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.39 
 
 		 751 aa  157  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.39 
 
 		 751 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.39 
 
 		 753 aa  157  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.39 
 
 		 751 aa  157  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  30.63 
 
 		 797 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.54 
 
 		 797 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.78 
 
 		 755 aa  157  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  27.47 
 
 		 672 aa  157  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.8 
 
 		 658 aa  157  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  24.83 
 
 		 769 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 682 aa  156  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  23.33 
 
 		 722 aa  156  2e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  25.72 
 
 		 714 aa  156  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.28 
 
 		 673 aa  156  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.47 
 
 		 741 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  28.09 
 
 		 739 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.9 
 
 		 759 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 718 aa  155  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 678 aa  155  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  29.51 
 
 		 1111 aa  155  5e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>