86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2752 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  230  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  69.44 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  35.35 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 117 aa  51.2  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0683  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3859  hypothetical protein  39.68 
 
 		 233 aa  50.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 497 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0455  helix-turn-helix domain-containing protein  38.16 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.846585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1422  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 652 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0082  DNA-binding protein  40.32 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0070  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5234  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302998 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7274  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21577  normal  0.150525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 252 aa  45.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5920  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 		 407 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6563  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5312  XRE family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 490 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2997  transcriptional regulator, XRE family  33.68 
 
 		 318 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  34.33 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  34.33 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0059  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  37.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0086  hipB protein, putative  42.62 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.288329  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  31.58 
 
 		 191 aa  42  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2395  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  37.14 
 
 		 156 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  38.1 
 
 		 484 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1349  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 97 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3185  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 421 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 197 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0038  XRE family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0669  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  29.67 
 
 		 280 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 277 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  34.21 
 
 		 196 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0407  transcriptional regulator  35.44 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1436  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.118358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5402  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  40.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3404  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 424 aa  40.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  29.59 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  29.59 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  29.59 
 
 		 217 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4613  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 178 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2184  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 289 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  48.65 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4592  helix-turn-helix domain protein  32.67 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  40  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  27.55 
 
 		 132 aa  40  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0070  XRE family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 52 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 		 256 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 98 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 		 68 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>