More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3754 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  45.42 
 
 		 1050 aa  723    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  59.7 
 
 		 1060 aa  1145    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  62.4 
 
 		 1074 aa  1164    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  59.01 
 
 		 1044 aa  1145    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  44.28 
 
 		 1134 aa  722    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.88 
 
 		 1066 aa  708    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  49.39 
 
 		 1062 aa  731    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  62.23 
 
 		 1051 aa  1191    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  45.16 
 
 		 1095 aa  729    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1059 aa  2087    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  41.53 
 
 		 1040 aa  648    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  48.81 
 
 		 1096 aa  768    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  48.16 
 
 		 1144 aa  770    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  42.93 
 
 		 1135 aa  629  1e-178  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  44.33 
 
 		 1103 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  42.21 
 
 		 1098 aa  566  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  38.56 
 
 		 1055 aa  544  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  39.27 
 
 		 1038 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  38.32 
 
 		 1038 aa  538  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  38.03 
 
 		 1129 aa  528  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  40.13 
 
 		 1076 aa  524  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  39.32 
 
 		 1051 aa  519  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  39.32 
 
 		 1051 aa  519  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  40.2 
 
 		 1099 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.86 
 
 		 1124 aa  505  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  39.04 
 
 		 1051 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  36.06 
 
 		 1115 aa  487  1e-136  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  37.85 
 
 		 1094 aa  486  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  36.17 
 
 		 1150 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  37.6 
 
 		 1085 aa  439  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  32.78 
 
 		 1059 aa  421  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.82 
 
 		 1145 aa  390  1e-107  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.96 
 
 		 1083 aa  382  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  54.42 
 
 		 1060 aa  383  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  37.22 
 
 		 1197 aa  356  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.56 
 
 		 1058 aa  348  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 1019 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 946 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 946 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.62 
 
 		 785 aa  191  8e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  24.9 
 
 		 731 aa  189  3e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.36 
 
 		 1016 aa  184  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  26.17 
 
 		 666 aa  182  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.35 
 
 		 729 aa  182  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  31 
 
 		 1162 aa  182  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.13 
 
 		 755 aa  181  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  24.87 
 
 		 749 aa  178  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 735 aa  177  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.53 
 
 		 707 aa  177  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  27 
 
 		 696 aa  177  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.59 
 
 		 1111 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  28.66 
 
 		 1073 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.17 
 
 		 694 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  24.97 
 
 		 706 aa  174  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  23.92 
 
 		 722 aa  174  9e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  28.99 
 
 		 728 aa  173  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  31.73 
 
 		 1162 aa  174  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.61 
 
 		 759 aa  173  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  30 
 
 		 1108 aa  172  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.74 
 
 		 781 aa  173  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 		 807 aa  173  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.74 
 
 		 781 aa  172  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  26.13 
 
 		 668 aa  171  6e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  24.88 
 
 		 757 aa  171  7e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.22 
 
 		 729 aa  171  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.32 
 
 		 739 aa  171  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.6 
 
 		 1228 aa  171  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  27.6 
 
 		 721 aa  170  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.03 
 
 		 715 aa  170  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  29.7 
 
 		 1144 aa  169  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.41 
 
 		 671 aa  169  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  27.55 
 
 		 762 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 787 aa  169  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  27.56 
 
 		 721 aa  169  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.62 
 
 		 741 aa  168  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  29.75 
 
 		 1041 aa  167  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.49 
 
 		 1094 aa  167  9e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 741 aa  167  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.24 
 
 		 797 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.03 
 
 		 773 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  28.44 
 
 		 706 aa  166  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  28.61 
 
 		 736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  30.04 
 
 		 1091 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  24.14 
 
 		 755 aa  166  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.73 
 
 		 753 aa  166  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  29.92 
 
 		 726 aa  165  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.73 
 
 		 753 aa  165  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26 
 
 		 747 aa  164  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  26 
 
 		 751 aa  164  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  26 
 
 		 753 aa  164  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  29.59 
 
 		 1124 aa  164  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26 
 
 		 751 aa  164  7e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26 
 
 		 751 aa  164  7e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  31.16 
 
 		 1111 aa  164  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 		 764 aa  164  8.000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  27.5 
 
 		 688 aa  164  8.000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  27.43 
 
 		 723 aa  164  9e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  25.31 
 
 		 689 aa  163  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 		 813 aa  163  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000846771 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  27.78 
 
 		 900 aa  163  2e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>