More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0453 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  100 
 
 		 470 aa  971    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  37.23 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  37.23 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  37.44 
 
 		 515 aa  312  6.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  25 
 
 		 447 aa  123  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 447 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  25.05 
 
 		 445 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  25.48 
 
 		 523 aa  110  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  25.49 
 
 		 446 aa  106  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  24.04 
 
 		 444 aa  103  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  26.3 
 
 		 423 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  23.98 
 
 		 491 aa  100  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  24.78 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 		 458 aa  99  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  23.36 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  27.58 
 
 		 449 aa  97.1  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  22.15 
 
 		 441 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.46 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  23.38 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2633  outer membrane efflux protein  23.35 
 
 		 424 aa  93.2  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  28.04 
 
 		 431 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  23.89 
 
 		 413 aa  90.9  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 		 441 aa  90.5  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.8 
 
 		 420 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.03 
 
 		 431 aa  87.4  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  24.69 
 
 		 535 aa  86.7  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  26.72 
 
 		 437 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.03 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  22.41 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  26.05 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0879  Outer membrane efflux protein  20.09 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.175744  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1759  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 738 aa  80.1  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3625  outer membrane efflux protein  23.55 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.262442  normal  0.276667 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5078  outer membrane efflux protein  23.39 
 
 		 635 aa  78.2  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.851054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  24.64 
 
 		 446 aa  77  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  22.51 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  22.75 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  20.65 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0785  Outer membrane efflux protein  22.87 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  23.83 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  20.09 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.36 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  22.85 
 
 		 469 aa  69.7  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.85 
 
 		 467 aa  69.7  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.99 
 
 		 489 aa  69.3  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01091  RND family outer membrane efflux protein  25.19 
 
 		 476 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  23.19 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.15 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3184  outer membrane efflux protein  23.79 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0733975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.48 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  21.03 
 
 		 463 aa  67  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.15 
 
 		 471 aa  66.6  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  26.2 
 
 		 627 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  23.64 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.37 
 
 		 464 aa  66.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2950  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.55 
 
 		 479 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.46 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1525  outer membrane efflux protein  26.87 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000580745  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 972 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  22.63 
 
 		 1470 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  23.34 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  25.89 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0515  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.47 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0532  outer membrane efflux protein  21.54 
 
 		 578 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52231  normal  0.0114882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25 
 
 		 495 aa  64.7  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  22 
 
 		 493 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0046  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.94 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1721  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.94 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.456925  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3155  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.94 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.267117  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2822  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.94 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.390937  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3620  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.94 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  22.48 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.39 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3644  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.24 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0814  outer membrane efflux protein, putative  22.54 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.933742  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3628  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.64 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.36 
 
 		 576 aa  62.8  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.32 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  24.92 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  19.43 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02231  RND family outer membrane efflux protein  23.53 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04010  RND efflux system, outer membrane lipoprotein  22.82 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.174506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1595  multidrug efflux system outer membrane subunit  27.21 
 
 		 520 aa  62  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  21 
 
 		 463 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0384  outer membrane efflux protein  19.53 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.895564  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.89 
 
 		 472 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  22.47 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  18.28 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>