159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1094 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  45.31 
 
 		 256 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  45.78 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  40.82 
 
 		 289 aa  141  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  30.11 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2318  hypothetical protein  34.31 
 
 		 565 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.115468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  35.68 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.74 
 
 		 246 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  27.87 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  27.27 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  24.7 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  26.61 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  19.92 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3128  transcriptional regulator, XRE family  24.61 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0824833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  24.82 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  26.12 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1185  transcriptional regulator, XRE family  21.79 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000101006  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2257  hypothetical protein  28.86 
 
 		 285 aa  72  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.347318  normal  0.175939 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0529  helix-turn-helix domain-containing protein  27.61 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.235438  normal  0.474385 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  26.05 
 
 		 284 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0079  hypothetical protein  29.65 
 
 		 333 aa  68.6  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4046  XRE family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  26.67 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1596  XRE family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.778872  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1282  XRE family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.181743 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3795  hypothetical protein  21.94 
 
 		 303 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1465  transcriptional regulator, XRE family  19.57 
 
 		 234 aa  64.7  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3632  hypothetical protein  21.94 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000216047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3918  hypothetical protein  21.94 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1932  hypothetical protein  27.09 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.240764  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1604  transcriptional regulator, XRE family  27.09 
 
 		 326 aa  64.3  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0722397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  25.82 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3524  hypothetical protein  21.94 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00215558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0593  hypothetical protein  24.39 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1418  hypothetical protein  21.86 
 
 		 304 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000154024  normal  0.202386 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1623  hypothetical protein  38.24 
 
 		 378 aa  62  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0072792  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3542  hypothetical protein  21.58 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000464083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3553  hypothetical protein  21.2 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  23.76 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7851  putative dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component  39.74 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187793  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0520  hypothetical protein  22.81 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1821  hypothetical protein  24.44 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3313  hypothetical protein  36.51 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3881  hypothetical protein  21.22 
 
 		 303 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00307099  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2019  hypothetical protein  32.2 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1227  hypothetical protein  36.51 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0535781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1298  hypothetical protein  36.51 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.445339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1228  hypothetical protein  36.51 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1466  hypothetical protein  29.27 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01055  hypothetical protein  23.77 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.760884  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06111  hypothetical protein  23.77 
 
 		 286 aa  56.6  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.249477  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1333  integral membrane protein  24.84 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380936  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2434  hypothetical protein  36.62 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0163428  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1394  putative DNA-binding protein  24.22 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1468  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.520924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  32.86 
 
 		 304 aa  55.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1186  hypothetical protein  22.49 
 
 		 266 aa  55.1  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.613527  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1621  hypothetical protein  22.76 
 
 		 300 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000792203 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  23.17 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2234  XRE-family DNA-binding domain-containing protein  28.17 
 
 		 298 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1340  Xre-like DNA-binding protein  30.56 
 
 		 340 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000360775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0397  hypothetical protein  32.63 
 
 		 773 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  24.23 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2653  hypothetical protein  31.75 
 
 		 361 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  35.62 
 
 		 436 aa  54.3  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0866  hypothetical protein  27.63 
 
 		 441 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.753935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3817  hypothetical protein  19.78 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000172076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3830  hypothetical protein  19.79 
 
 		 308 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000092193  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1269  hypothetical protein  31.62 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1663  hypothetical protein  24.4 
 
 		 293 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000864881  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1502  hypothetical protein  27.73 
 
 		 189 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1481  hypothetical protein  27.73 
 
 		 189 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1185  hypothetical protein  24.49 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1431  hypothetical protein  20.36 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.164911  normal  0.214757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3592  hypothetical protein  31.71 
 
 		 566 aa  50.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0990  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 314 aa  50.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0746  hypothetical protein  35.14 
 
 		 510 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.204692  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1372  hypothetical protein  24.79 
 
 		 361 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0303948  normal  0.0676016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2991  hypothetical protein  24.79 
 
 		 356 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000645272  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3149  hypothetical protein  24.79 
 
 		 361 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.301792  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0849  Cro/CI family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 130 aa  49.7  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  32.17 
 
 		 407 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1126  hypothetical protein  26.83 
 
 		 340 aa  49.7  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.869232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3006  hypothetical protein  24.79 
 
 		 356 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000608757  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0582  Xre-like DNA-binding protein  30.1 
 
 		 291 aa  49.7  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0704393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3604  transcriptional regulator, putative  23.9 
 
 		 278 aa  49.3  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 307 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01066  hypothetical protein  28.4 
 
 		 321 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004350  hypothetical protein  36.92 
 
 		 323 aa  48.9  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1689  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 342 aa  48.9  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0347421 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0287  hypothetical protein  35.59 
 
 		 393 aa  48.9  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.151411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2853  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 351 aa  48.5  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2049  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 325 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.055212  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1384  Xre-like DNA-binding protein  31.43 
 
 		 324 aa  48.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  27.45 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0134  hypothetical protein  32.1 
 
 		 404 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.244573 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2193  hypothetical protein  23.96 
 
 		 380 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2608  hypothetical protein  31.43 
 
 		 372 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>