34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7851 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7851  putative dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component  100 
 
 		 138 aa  261  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187793  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  36.23 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  38.26 
 
 		 243 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  32.11 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3541  hypothetical protein  34.96 
 
 		 289 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0867414  normal  0.328029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2172  hypothetical protein  33.11 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1422  hypothetical protein  30.89 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.542489  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  31.4 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  36.84 
 
 		 338 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0838  XRE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1500  hypothetical protein  28.74 
 
 		 273 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.342716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  31.5 
 
 		 368 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 249 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1659  helix-turn-helix domain protein  31.53 
 
 		 266 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  30.71 
 
 		 368 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 281 aa  47.4  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.64 
 
 		 246 aa  47  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1064  PEGA domain-containing protein  37.18 
 
 		 300 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0650  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  46.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.918476  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1011  hypothetical protein  38.03 
 
 		 436 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0754154  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2681  transcriptional regulator, putative  35.44 
 
 		 280 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.11073  normal  0.597549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3481  hypothetical protein  31.19 
 
 		 309 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16006  normal  0.23992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1115  transcriptional regulator, putative  31.43 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1659  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.232922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1608  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 270 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.174572  normal  0.114559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1263  hypothetical protein  31.33 
 
 		 313 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3009  hypothetical protein  35.37 
 
 		 136 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  31.19 
 
 		 407 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  31.25 
 
 		 256 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  32.43 
 
 		 405 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08820  Helix-turn-helix  25.81 
 
 		 258 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000147566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5094  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 		 535 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000566508 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2554  transcriptional regulator, XRE family  29.7 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35211e-22 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0434  transcriptional regulator, putative  31.43 
 
 		 289 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0121378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>