22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0650 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0650  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.918476  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3746  hypothetical protein  40.74 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4218  hypothetical protein  41.46 
 
 		 407 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4013  hypothetical protein  39.53 
 
 		 368 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4051  hypothetical protein  38.37 
 
 		 368 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  42.65 
 
 		 307 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3307  hypothetical protein  29.88 
 
 		 248 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.189591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3112  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0185225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0395  transcriptional regulator, XRE family  39.24 
 
 		 287 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.302287  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0861  hypothetical protein  35.8 
 
 		 405 aa  45.8  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0100768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1263  hypothetical protein  32.86 
 
 		 245 aa  45.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1204  hypothetical protein  39.06 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00102705  normal  0.560918 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4317  hypothetical protein  25.58 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1932  hypothetical protein  39.06 
 
 		 251 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.405404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1073  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.98421 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0794  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  32.47 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.898651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1943  transcriptional regulator, putative  40.98 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1094  hypothetical protein  35.29 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0688912 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4433  hypothetical protein  38.89 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2078  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 297 aa  42.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7851  putative dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component  33.75 
 
 		 138 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.187793  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1294  hypothetical protein  28.71 
 
 		 295 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000310204  normal  0.331391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>