More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2062 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 419 aa  813    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.43 
 
 		 396 aa  280  3e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  43.75 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  43.35 
 
 		 398 aa  274  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  43.55 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  39.23 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  44.67 
 
 		 396 aa  239  5e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.22 
 
 		 390 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.53 
 
 		 389 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.94 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  45.82 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  39.53 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  37.17 
 
 		 399 aa  225  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.29 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.33 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  36.03 
 
 		 393 aa  215  9e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  38.14 
 
 		 407 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.61 
 
 		 387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  35.97 
 
 		 409 aa  207  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  32.2 
 
 		 392 aa  202  7e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  37.77 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  33.92 
 
 		 395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  38.42 
 
 		 522 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  36.15 
 
 		 389 aa  193  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  38.23 
 
 		 407 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  36.46 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  39.62 
 
 		 398 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 388 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.15 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.15 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  36.98 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  39.19 
 
 		 393 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  34.13 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.5 
 
 		 393 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  44.56 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.63 
 
 		 391 aa  137  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.39 
 
 		 393 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.65 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.93 
 
 		 416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.21 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  27.58 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3461  secretion protein HlyD  27.01 
 
 		 384 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.31 
 
 		 413 aa  95.5  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.95 
 
 		 388 aa  94.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  30.94 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  27.11 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  27.34 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.59 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 377 aa  86.7  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1985  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.51 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0770  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.82 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0433625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1007  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.3 
 
 		 398 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  30.08 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  23.06 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1840  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.27 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.772932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4563  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.94 
 
 		 426 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  27.79 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0607  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0635  RND family efflux transporter MFP subunit  23.89 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.320707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.31 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  27.07 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  26.46 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  19.95 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4588  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.39 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00044707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  27.32 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.62 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.32 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.61 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  27.91 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.37 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  24.92 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4837  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.59 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  24.1 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.01 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  24.83 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.54 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  26.4 
 
 		 405 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  25.06 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.3 
 
 		 379 aa  76.6  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.144925 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  25.06 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  29.14 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.14 
 
 		 374 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1857  secretion protein HlyD  24.09 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1423  RND family efflux transporter MFP subunit  23.04 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.34 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  25.06 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  25.06 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.7 
 
 		 351 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  25.06 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2754  RND efflux transporter  23.04 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  25.06 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  25.06 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  20.94 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2116  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  27.86 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1685  RND family efflux transporter MFP subunit  26.11 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261181  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>