More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2625 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
579 aa  1191    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  58.23 
 
 
577 aa  711    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  51.03 
 
 
588 aa  615  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  46.19 
 
 
587 aa  543  1e-153  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  46.79 
 
 
579 aa  525  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.14 
 
 
588 aa  521  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.15 
 
 
577 aa  505  1e-141  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  42.04 
 
 
577 aa  491  1e-137  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  42.83 
 
 
578 aa  478  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  42.83 
 
 
578 aa  478  1e-133  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  37.7 
 
 
577 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  37.7 
 
 
577 aa  431  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  39.29 
 
 
581 aa  415  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.42 
 
 
574 aa  412  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  38.32 
 
 
581 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  38.58 
 
 
605 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  37.07 
 
 
574 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.84 
 
 
581 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.37 
 
 
585 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  38.1 
 
 
579 aa  365  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
579 aa  362  1e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.7 
 
 
581 aa  353  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.39 
 
 
582 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.36 
 
 
581 aa  344  2e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 
593 aa  335  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  38.1 
 
 
578 aa  330  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  38.15 
 
 
577 aa  328  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.87 
 
 
576 aa  323  4e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.67 
 
 
577 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  31.97 
 
 
596 aa  319  9e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.93 
 
 
603 aa  318  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  37.6 
 
 
593 aa  317  4e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.55 
 
 
581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.71 
 
 
597 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.37 
 
 
1228 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.87 
 
 
579 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.02 
 
 
592 aa  308  1.0000000000000001e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.98 
 
 
611 aa  301  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  33.27 
 
 
608 aa  300  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.56 
 
 
584 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.23 
 
 
581 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.27 
 
 
581 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  34.62 
 
 
597 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.08 
 
 
596 aa  297  4e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 
618 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.87 
 
 
604 aa  296  9e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  31.7 
 
 
580 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.62 
 
 
580 aa  290  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.93 
 
 
576 aa  290  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  28.32 
 
 
583 aa  289  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.08 
 
 
589 aa  289  9e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.06 
 
 
581 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.65 
 
 
568 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  29.4 
 
 
587 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  32.38 
 
 
592 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  29.4 
 
 
587 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.72 
 
 
595 aa  287  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.53 
 
 
585 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  30.81 
 
 
575 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  32.82 
 
 
590 aa  286  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.29 
 
 
593 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34 
 
 
600 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  31.33 
 
 
585 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.88 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  31.22 
 
 
582 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34 
 
 
574 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.51 
 
 
572 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  34.36 
 
 
598 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.78 
 
 
627 aa  280  7e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  34.15 
 
 
611 aa  278  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  31.05 
 
 
619 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  33.4 
 
 
582 aa  276  6e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.12 
 
 
573 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  33.12 
 
 
573 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  32.35 
 
 
606 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.02 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.95 
 
 
611 aa  274  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  34.75 
 
 
584 aa  274  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.95 
 
 
611 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  28.95 
 
 
593 aa  273  6e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  32.79 
 
 
579 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.57 
 
 
618 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  33.05 
 
 
1138 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  32.76 
 
 
595 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.47 
 
 
582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  30.2 
 
 
571 aa  270  7e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.51 
 
 
573 aa  270  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  33.27 
 
 
599 aa  269  1e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  33.15 
 
 
609 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  28.84 
 
 
577 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  31.68 
 
 
598 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  33.2 
 
 
602 aa  268  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  30.76 
 
 
609 aa  267  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  30.28 
 
 
607 aa  266  8e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  32.8 
 
 
600 aa  266  1e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.9 
 
 
581 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  30.77 
 
 
573 aa  265  3e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.38 
 
 
1091 aa  263  6.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.17 
 
 
577 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  34.95 
 
 
591 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>