120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2323 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2323  mechanosensitive ion channel family protein  100 
 
 		 406 aa  822    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1739  MscS mechanosensitive ion channel  41.79 
 
 		 395 aa  309  5.9999999999999995e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2763  MscS mechanosensitive ion channel  41.34 
 
 		 421 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0968  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.58 
 
 		 403 aa  306  6e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0457255  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0117  MscS mechanosensitive ion channel  38.74 
 
 		 422 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222536 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4442  MscS mechanosensitive ion channel  40.19 
 
 		 420 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3919  MscS mechanosensitive ion channel  39.31 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3267  MscS Mechanosensitive ion channel  39.56 
 
 		 459 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0117  MscS mechanosensitive ion channel  38.5 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0112  MscS mechanosensitive ion channel  38.5 
 
 		 422 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.99072 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  42.01 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0121  small-conductance mechanosensitive channel  39.95 
 
 		 392 aa  298  1e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0118  MscS mechanosensitive ion channel  38.59 
 
 		 422 aa  298  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0327583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4237  MscS mechanosensitive ion channel  39.43 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0117  MscS mechanosensitive ion channel  39.43 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0122  MscS mechanosensitive ion channel  39.43 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0121  MscS Mechanosensitive ion channel  39.43 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0018  MscS mechanosensitive ion channel  48.44 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3752  MscS mechanosensitive ion channel  37.68 
 
 		 416 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582407 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0086  MscS mechanosensitive ion channel  38.2 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.845728  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1640  MscS mechanosensitive ion channel  48.66 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.868645  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3632  putative small-conductance mechanosensitive channel  38.64 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0774  MscS Mechanosensitive ion channel  40.67 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0634  hypothetical protein  39.24 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1692  MscS Mechanosensitive ion channel  40 
 
 		 403 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105564 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2129  MscS mechanosensitive ion channel  44.85 
 
 		 442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4834  MscS mechanosensitive ion channel  39.61 
 
 		 421 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1801  hypothetical protein  48.6 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1733  MscS mechanosensitive ion channel  48.76 
 
 		 444 aa  282  7.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00538  predicted mechanosensitive channel  46.91 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3052  MscS Mechanosensitive ion channel  46.91 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0658  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  39.81 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2643  hypothetical protein  45.28 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0624  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  46.91 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.248163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3069  MscS mechanosensitive ion channel  46.91 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.588458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  46.91 
 
 		 415 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0595  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  46.91 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.734376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0471  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family  46.91 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1064  MscS mechanosensitive ion channel  38.35 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.734734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0330  MscS Mechanosensitive ion channel  45.45 
 
 		 423 aa  279  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3951  MscS mechanosensitive ion channel  43.18 
 
 		 422 aa  275  9e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1014  MscS Mechanosensitive ion channel  48.9 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3295  MscS Mechanosensitive ion channel  47.79 
 
 		 424 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4829  mechanosensitive ion channel  47.33 
 
 		 417 aa  273  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1305  MscS mechanosensitive ion channel  48.23 
 
 		 433 aa  271  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.409264 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10263  putative transmembrane transport protein  39.72 
 
 		 428 aa  269  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.109786  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0670  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  40.62 
 
 		 415 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.74208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0680  small conductance mechanosensitive ion channel family transporter  40.62 
 
 		 415 aa  268  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0614  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel  39.69 
 
 		 415 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0621  small conductance mechanosensitive ion channel transporter  44.2 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.841631 
 
 
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NC_011094  SeSA_A0736  transporter small conductance mechanosensitive ion channel  40.62 
 
 		 415 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4158  MscS mechanosensitive ion channel  37.83 
 
 		 419 aa  266  5e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4577  MscS mechanosensitive ion channel  37.81 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5728  MscS mechanosensitive ion channel  37.81 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.934424 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4004  MscS mechanosensitive ion channel  45 
 
 		 453 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.2264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4466  MscS mechanosensitive ion channel  44.64 
 
 		 413 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0321  MscS mechanosensitive ion channel  45.99 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.870771  normal  0.0509238 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3791  MscS mechanosensitive ion channel  37.81 
 
 		 464 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0882  MscS mechanosensitive ion channel  37.31 
 
 		 420 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1436  MscS mechanosensitive ion channel  46.6 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4067  MscS mechanosensitive ion channel  38.11 
 
 		 424 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2846  MscS mechanosensitive ion channel  38.24 
 
 		 419 aa  260  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1534  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.26 
 
 		 414 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1048  MscS mechanosensitive ion channel  39.9 
 
 		 421 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.23131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1729  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  49.26 
 
 		 414 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.454596  hitchhiker  0.0000587449 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1641  MscS mechanosensitive ion channel  49.26 
 
 		 414 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03630  mechanosensitive ion channel  45.86 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1574  mechanosensitive ion channel family protein  40.46 
 
 		 436 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19230  hypothetical protein  50.19 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.895038 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1659  hypothetical protein  49.81 
 
 		 442 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.372862  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3803  MscS mechanosensitive ion channel  46.58 
 
 		 430 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398748 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1267  MscS mechanosensitive ion channel  44.57 
 
 		 416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4040  MscS mechanosensitive ion channel  41.52 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435136 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3828  MscS mechanosensitive ion channel  40.87 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280894  normal  0.277572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4533  MscS mechanosensitive ion channel  41.23 
 
 		 433 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1377  MscS mechanosensitive ion channel  40.94 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1821  MscS mechanosensitive ion channel  42.05 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.626552  decreased coverage  0.00243652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4057  MscS mechanosensitive ion channel  39.07 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1801  MscS mechanosensitive ion channel  41.25 
 
 		 437 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02197  hypothetical protein  32.28 
 
 		 490 aa  237  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6004  MscS mechanosensitive ion channel  36.15 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6222  MscS Mechanosensitive ion channel  32.28 
 
 		 404 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1331  MscS mechanosensitive ion channel  29.21 
 
 		 541 aa  143  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.434406  hitchhiker  0.00000000000183262 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0013  mechanosensitive ion channel family protein  25.42 
 
 		 682 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1737  mechanosensitive ion channel family protein  25 
 
 		 624 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.64597  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3246  MscS mechanosensitive ion channel  23.85 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00298811  n/a   
 
 
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NC_008312  Tery_4761  MscS mechanosensitive ion channel  26.81 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617283  normal  0.0605125 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0887  MscS mechanosensitive ion channel  21.56 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0881194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2451  small-conductance mechanosensitive channel  24.61 
 
 		 380 aa  57  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2527  MscS mechanosensitive ion channel  27.92 
 
 		 566 aa  55.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.131998  normal  0.145786 
 
 
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NC_012039  Cla_1504  conserved hypothetical integral membrane protein, mechanosensitive ion channel family  23.1 
 
 		 624 aa  52.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009715  CCV52592_2117  mechanosensitive ion channel family protein  23.66 
 
 		 633 aa  50.4  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_0938  MscS Mechanosensitive ion channel  22.6 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.466834  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0195  MscS mechanosensitive ion channel  21.61 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0052728  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_0935  MscS Mechanosensitive ion channel  22.29 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.940167  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_0941  MscS mechanosensitive ion channel  22.46 
 
 		 467 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884334  normal  0.631146 
 
 
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NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  24.48 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008787  CJJ81176_0263  mechanosensitive ion channel family protein  22.89 
 
 		 627 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003912  CJE0289  mechanosensitive ion channel family protein  23.69 
 
 		 627 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.658149  n/a   
 
 
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