272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10536 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  100 
 
 
202 aa  409  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  68.69 
 
 
209 aa  278  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  64.82 
 
 
215 aa  265  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  67.01 
 
 
208 aa  263  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  62.44 
 
 
209 aa  261  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  62.19 
 
 
211 aa  254  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  65.15 
 
 
202 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  65.15 
 
 
202 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  65.15 
 
 
202 aa  254  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  58.21 
 
 
230 aa  247  9e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  62.44 
 
 
212 aa  245  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  59.6 
 
 
217 aa  243  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  63.96 
 
 
200 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  63.82 
 
 
211 aa  241  7.999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  58.88 
 
 
208 aa  237  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  60.94 
 
 
218 aa  235  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.72 
 
 
212 aa  235  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  58.88 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  62.56 
 
 
218 aa  230  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  59.2 
 
 
223 aa  229  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  57.79 
 
 
214 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  57.07 
 
 
226 aa  226  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  58.29 
 
 
214 aa  225  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  58.88 
 
 
214 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  59.3 
 
 
258 aa  222  4e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  58.29 
 
 
216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  56.57 
 
 
214 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  57.97 
 
 
215 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  53.3 
 
 
221 aa  206  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  50.75 
 
 
211 aa  205  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  57.36 
 
 
215 aa  204  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  52.48 
 
 
211 aa  204  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  53.23 
 
 
229 aa  200  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  50.23 
 
 
226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  58.97 
 
 
215 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  54.15 
 
 
224 aa  193  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  41.59 
 
 
219 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 
230 aa  138  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 
219 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  40.2 
 
 
224 aa  68.9  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  38.56 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.76 
 
 
369 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
240 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  39.74 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 
440 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  43.75 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
208 aa  59.3  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
204 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  32.34 
 
 
243 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.8 
 
 
356 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.84 
 
 
227 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  39.18 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.68 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 
213 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.17 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.62 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 
233 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  40.43 
 
 
207 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
230 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  39.36 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.3 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.36 
 
 
223 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
207 aa  55.1  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
215 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
215 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
215 aa  54.7  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.29 
 
 
235 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2159  hypothetical protein  30.63 
 
 
213 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 
391 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
412 aa  54.7  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
212 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
363 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
226 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  42.31 
 
 
234 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  43.9 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  45.12 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  34.9 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 
258 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 
201 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  27.36 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
370 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  32.97 
 
 
189 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
220 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.58 
 
 
222 aa  52.4  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>