More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0725 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 469 aa  960    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2475  type III restriction protein res subunit  46.57 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0815969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  46.36 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2616  type III restriction enzyme, res subunit  42.51 
 
 		 459 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0606315  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  33.05 
 
 		 629 aa  246  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.2 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3307  type III restriction protein res subunit  36.06 
 
 		 536 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  32.69 
 
 		 550 aa  179  1e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1623  helicase domain-containing protein  31.16 
 
 		 502 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  32.86 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  31.48 
 
 		 569 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0992  type III restriction protein res subunit  33.53 
 
 		 938 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.942343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  33.79 
 
 		 545 aa  160  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  33.24 
 
 		 545 aa  159  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  31.39 
 
 		 503 aa  159  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 812 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  31.69 
 
 		 385 aa  157  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  29.39 
 
 		 848 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  30.99 
 
 		 1077 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  32.69 
 
 		 545 aa  153  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  30.84 
 
 		 773 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  30.03 
 
 		 905 aa  152  2e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  32.96 
 
 		 1033 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  33.24 
 
 		 1033 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2849  type III restriction enzyme, res subunit  30.95 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 586 aa  146  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  34.67 
 
 		 928 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8756  type III restriction enzyme, res subunit  34.13 
 
 		 1028 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  32.77 
 
 		 1051 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  33.5 
 
 		 606 aa  144  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  28.61 
 
 		 967 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  34.06 
 
 		 956 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  33 
 
 		 607 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2917  type III restriction enzyme, res subunit  26.25 
 
 		 538 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.633235  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  28.74 
 
 		 815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  33.75 
 
 		 524 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  26.21 
 
 		 813 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  30.47 
 
 		 586 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  30.71 
 
 		 586 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  30.47 
 
 		 586 aa  140  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  30.47 
 
 		 586 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  30.47 
 
 		 586 aa  140  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  30.47 
 
 		 586 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  30.47 
 
 		 586 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  31.38 
 
 		 1287 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  30.22 
 
 		 586 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  30.22 
 
 		 586 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  30.22 
 
 		 586 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  30.47 
 
 		 586 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  30.22 
 
 		 586 aa  138  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  31.03 
 
 		 1029 aa  137  6.0000000000000005e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  30.22 
 
 		 586 aa  136  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  30.56 
 
 		 643 aa  135  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  30.51 
 
 		 1052 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  29.23 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  30.14 
 
 		 1042 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  30.11 
 
 		 1061 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  29.95 
 
 		 1062 aa  134  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2492  type III restriction protein res subunit  33.24 
 
 		 1066 aa  133  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  33.06 
 
 		 1058 aa  133  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  31.66 
 
 		 583 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  31.48 
 
 		 583 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  26.86 
 
 		 1053 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  28.1 
 
 		 585 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0977  type III restriction enzyme, res subunit  32.27 
 
 		 1063 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2606  type III restriction enzyme, res subunit  28.61 
 
 		 560 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2770  type III restriction enzyme, res subunit  30.77 
 
 		 560 aa  131  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547342  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  29.8 
 
 		 967 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1235  type III restriction enzyme, res subunit  30.28 
 
 		 560 aa  130  6e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  29.48 
 
 		 586 aa  129  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  30.58 
 
 		 1041 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  30.4 
 
 		 982 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  27.62 
 
 		 586 aa  129  8.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  26.1 
 
 		 993 aa  129  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  27.41 
 
 		 586 aa  129  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  32.74 
 
 		 1043 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  25.45 
 
 		 580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  29.21 
 
 		 591 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0844  type III restriction enzyme, res subunit  28.84 
 
 		 613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  30.06 
 
 		 1051 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1300  type III restriction enzyme, res subunit  29.24 
 
 		 560 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.49268  normal  0.27314 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  28.72 
 
 		 979 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.63 
 
 		 1031 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  29.83 
 
 		 1055 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  27.2 
 
 		 585 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 		 1348 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  29.19 
 
 		 585 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  29.19 
 
 		 585 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  26.36 
 
 		 580 aa  126  7e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.15 
 
 		 657 aa  126  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  24.9 
 
 		 580 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  30.4 
 
 		 1017 aa  126  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  26.3 
 
 		 602 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2074  type III restriction enzyme, res subunit  29.24 
 
 		 560 aa  126  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.432643  normal  0.155491 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3738  type III restriction protein res subunit  32.4 
 
 		 1035 aa  126  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2845  type III restriction enzyme, res subunit  29.58 
 
 		 560 aa  125  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3809  type III restriction enzyme, res subunit  29.46 
 
 		 1033 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  29.89 
 
 		 1065 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  28.96 
 
 		 585 aa  125  2e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  26.3 
 
 		 946 aa  124  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>