156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0447 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  44.44 
 
 		 155 aa  101  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  39.69 
 
 		 162 aa  99.4  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  38.57 
 
 		 183 aa  84.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  35.04 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.08 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.33 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  34.81 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  33.1 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  32.35 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  35.19 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  28.97 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  26.54 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  28.03 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  33.11 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  30.72 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  30.46 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  32.89 
 
 		 187 aa  70.9  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  32.86 
 
 		 196 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.55 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  36.57 
 
 		 169 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.57 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.88 
 
 		 232 aa  67.8  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.09 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  33.09 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  25.38 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  30.67 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  26.25 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  26.51 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  30.82 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  30.82 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  32.33 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.95 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  35.34 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  28.76 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  27.92 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  26.32 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  27.49 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  29.01 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  29.53 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  32.14 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  32.14 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  29.59 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  28.19 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  29.86 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  30.06 
 
 		 227 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  26.02 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  27.07 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  27.39 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  34.19 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  25.3 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  30.34 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.48 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.1 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.81 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  33.94 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  30 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  28.86 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  26.67 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  25.5 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  24.72 
 
 		 267 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  28.97 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  32.21 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  29.17 
 
 		 273 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.45 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  28.57 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  31.54 
 
 		 278 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  29.94 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.34 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  28.47 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  26.83 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  26.83 
 
 		 190 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  34.29 
 
 		 534 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  29.92 
 
 		 388 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  27.66 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  30.99 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  27.21 
 
 		 214 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  28.57 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  29.79 
 
 		 372 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  29.58 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  25.52 
 
 		 247 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  29.41 
 
 		 255 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  29.01 
 
 		 226 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.75 
 
 		 244 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  28.68 
 
 		 255 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  27.22 
 
 		 221 aa  50.4  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  29.29 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  28.57 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  31.88 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  35.05 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  30.71 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  31.69 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  30.21 
 
 		 237 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  27.59 
 
 		 183 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>