207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0298 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  80.82 
 
 		 464 aa  796    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  75.28 
 
 		 475 aa  721    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  71.52 
 
 		 479 aa  690    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  77.26 
 
 		 479 aa  751    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  75.75 
 
 		 471 aa  741    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  100 
 
 		 472 aa  974    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  78.48 
 
 		 472 aa  766    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  91.53 
 
 		 472 aa  904    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  77.85 
 
 		 465 aa  774    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  80.51 
 
 		 474 aa  800    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  75.72 
 
 		 475 aa  725    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4011  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  74.61 
 
 		 459 aa  721    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  76.99 
 
 		 466 aa  771    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  76.6 
 
 		 473 aa  760    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  81.22 
 
 		 462 aa  791    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  83.47 
 
 		 472 aa  828    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  67.33 
 
 		 477 aa  640    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  77.42 
 
 		 466 aa  771    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  56.03 
 
 		 624 aa  550  1e-155  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  56.2 
 
 		 599 aa  537  1e-151  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  56.46 
 
 		 589 aa  534  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  57.97 
 
 		 552 aa  529  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  40.53 
 
 		 463 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  41.45 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  40.73 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  40.17 
 
 		 453 aa  330  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  39.07 
 
 		 453 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  39.57 
 
 		 453 aa  326  6e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  38.53 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  38.66 
 
 		 455 aa  322  6e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  36.46 
 
 		 460 aa  290  5.0000000000000004e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1176  Carotene 7,8-desaturase  37.39 
 
 		 462 aa  282  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.180076  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1173  zeta-carotene desaturase  36.49 
 
 		 461 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000320899  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  36.67 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  35.31 
 
 		 484 aa  277  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  35.57 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  34.9 
 
 		 484 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0877  Carotene 7,8-desaturase  36.67 
 
 		 460 aa  272  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0378337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  36.71 
 
 		 459 aa  271  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  34.96 
 
 		 499 aa  270  4e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  34.08 
 
 		 484 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  32.8 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  32.8 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  33.27 
 
 		 489 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  33.13 
 
 		 488 aa  249  7e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  33.4 
 
 		 483 aa  249  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  33.06 
 
 		 486 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  32.66 
 
 		 486 aa  248  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  33.07 
 
 		 488 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  33.47 
 
 		 479 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  33.47 
 
 		 478 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26211  zeta-carotene desaturase  34.46 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.57594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 479 aa  239  8e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  33.26 
 
 		 482 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1512  zeta-carotene desaturase  34.44 
 
 		 481 aa  238  2e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.311968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  31.59 
 
 		 591 aa  219  6e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  26.81 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  28.12 
 
 		 481 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3204  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.06 
 
 		 477 aa  116  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.55236  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  26.45 
 
 		 503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4330  amine oxidase  25.86 
 
 		 500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0307  amine oxidase  24.07 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.9 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  25.59 
 
 		 520 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5715  amine oxidase  27.49 
 
 		 562 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0865614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4193  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.8 
 
 		 447 aa  99.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  23.75 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  23.75 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  23.75 
 
 		 452 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0821  amine oxidase  24.94 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.147648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  25.11 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  24.66 
 
 		 565 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  23.81 
 
 		 989 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2440  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  28.03 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  27.41 
 
 		 645 aa  70.1  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1093  zeta-carotene desaturase-like  23.86 
 
 		 544 aa  69.7  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.802606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2707  amine oxidase  26.15 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0288942  hitchhiker  0.00000819833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  23.54 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  28.57 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  28.57 
 
 		 647 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.49 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  24.79 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  24.79 
 
 		 506 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  25.38 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  23.29 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  23.38 
 
 		 438 aa  66.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  23.29 
 
 		 417 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  28.41 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.93 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.17 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33779  predicted protein  23.76 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1695  amine oxidase  23.65 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.916682  hitchhiker  0.0000276291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1470  amine oxidase  23.55 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.292882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6348  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.11 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0839028  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  22.77 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3813  amine oxidase  26.16 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.966571  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5505  squalene-associated FAD-dependent desaturase  22.25 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.342763  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6666  squalene-associated FAD-dependent desaturase  23.67 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  22.77 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>