238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0947 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0947  nitroreductase  100 
 
 		 226 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0863  nitroreductase  78.83 
 
 		 224 aa  370  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2969  nitroreductase  76.23 
 
 		 224 aa  368  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00135  nitroreductase  74.34 
 
 		 227 aa  363  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0762  nitroreductase  75.34 
 
 		 223 aa  364  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3203  nitroreductase  76.68 
 
 		 223 aa  362  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3676  nitroreductase family protein  68.45 
 
 		 205 aa  298  4e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0329631  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00908  nitroreductase family protein  65 
 
 		 224 aa  298  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1593  nitroreductase  56.31 
 
 		 222 aa  245  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0349292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2634  nitroreductase  53.21 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.872744 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2200  nitroreductase  58.97 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.244403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4783  nitroreductase  53.17 
 
 		 217 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0866516 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1728  nitroreductase  53.27 
 
 		 230 aa  207  7e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113712  normal  0.463075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2104  nitroreductase  46.43 
 
 		 223 aa  205  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0062642  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2247  nitroreductase  49.03 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.200242  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1916  nitroreductase  46.08 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2239  nitroreductase  45.45 
 
 		 239 aa  171  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.404063  hitchhiker  0.0000304556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  35.2 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  35.2 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0728  nitroreductase  33.5 
 
 		 182 aa  92.8  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.782562  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  29.8 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.75 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  31.69 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3037  nitroreductase  28.8 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  34.03 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  28.5 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  27.04 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3427  nitroreductase  34.29 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  26.67 
 
 		 252 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  47.92 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  25.95 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  31.47 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  42.59 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  37.5 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1220  nitroreductase family protein  24.76 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.168432  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2527  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  26.04 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  26.37 
 
 		 183 aa  54.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  29.2 
 
 		 167 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  44 
 
 		 174 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  26.4 
 
 		 176 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  26.02 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  41.51 
 
 		 166 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  41.67 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  31.31 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1959  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  35.05 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14382  normal  0.266961 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  41.51 
 
 		 166 aa  53.5  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  22.71 
 
 		 184 aa  53.1  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0804  nitroreductase  34.33 
 
 		 270 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00112064  normal  0.983564 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.53 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  28.73 
 
 		 184 aa  52.4  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  35 
 
 		 168 aa  52.4  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0797  nitroreductase family protein  41.3 
 
 		 270 aa  52  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0323416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5547  nitroreductase  34.43 
 
 		 241 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2003  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  36.36 
 
 		 166 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2280  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  24.71 
 
 		 174 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1724  nitroreductase  36.54 
 
 		 265 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0035876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3640  nitroreductase  37.74 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  36.49 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  25.73 
 
 		 334 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  27.59 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  32.91 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  46.81 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  34.78 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  31.48 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  27.03 
 
 		 167 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1524  nitroreductase  41.51 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0196672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  35.09 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  26.4 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  28.17 
 
 		 184 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  25 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  23.88 
 
 		 179 aa  49.7  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  23.32 
 
 		 178 aa  49.7  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  31.4 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  41.18 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  43.55 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0371  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.26 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  37.29 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  41.67 
 
 		 169 aa  48.9  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3715  nitroreductase  28.42 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0995943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  25.37 
 
 		 180 aa  48.5  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2246  nitroreductase  26.53 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  24.08 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  33.33 
 
 		 196 aa  48.5  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.67 
 
 		 176 aa  48.5  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5732  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.21 
 
 		 235 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0330  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.94 
 
 		 199 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1710  nitroreductase family protein  32.79 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  25.13 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0189  nitroreductase  25.64 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3640  nitroreductase  34.29 
 
 		 228 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  24.59 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  41.18 
 
 		 163 aa  47.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  40 
 
 		 176 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1328  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  27.27 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.92579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0382  nitroreductase  36.21 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2969  nitroreductase  30.26 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000187798  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1226  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.26 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33110  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase protein  33.87 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00411999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>