More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3671 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  76.36 
 
 		 336 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  76.67 
 
 		 336 aa  508  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  76.36 
 
 		 336 aa  508  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  71.52 
 
 		 336 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  50.78 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  51.09 
 
 		 328 aa  318  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  51.55 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  49.54 
 
 		 328 aa  311  6.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  48.14 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  50.31 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  46.82 
 
 		 328 aa  293  4e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  47.57 
 
 		 336 aa  293  4e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  47.06 
 
 		 327 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  45.94 
 
 		 332 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  46.11 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  46.52 
 
 		 335 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  45.54 
 
 		 329 aa  278  6e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  42.07 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  42.07 
 
 		 327 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  45.23 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  45.57 
 
 		 335 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  42.02 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  42.37 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  42.06 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  36.11 
 
 		 333 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  35.24 
 
 		 348 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  35.53 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  30.15 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  34.24 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  30.09 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  36.39 
 
 		 322 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  32.09 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  32.68 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  38.63 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  31.45 
 
 		 338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  36 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  32.12 
 
 		 308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4145  ATPase central domain-containing protein  34.02 
 
 		 388 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0147452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  41.71 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  38.71 
 
 		 405 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  35.45 
 
 		 335 aa  130  4.0000000000000003e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  31.96 
 
 		 370 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  31.56 
 
 		 360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  33.33 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  39.89 
 
 		 325 aa  126  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  39.43 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  39.51 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  30.94 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  25.8 
 
 		 363 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  41.36 
 
 		 390 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  30.47 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  34.52 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  32.45 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  32.45 
 
 		 323 aa  119  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  35.96 
 
 		 355 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  34.04 
 
 		 389 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  35.52 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  35.52 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  31.69 
 
 		 419 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2298  ATPase central domain-containing protein  38.6 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0513  AAA ATPase, central region  32.24 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  32.5 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  33.84 
 
 		 419 aa  109  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  36 
 
 		 428 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  31.14 
 
 		 430 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  35.47 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  31.08 
 
 		 459 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.09 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1670  peptidase M41, FtsH  34.17 
 
 		 663 aa  103  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  30.77 
 
 		 493 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  31.76 
 
 		 451 aa  103  4e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0441  putative cell division protease FtsH-like protein  35.39 
 
 		 641 aa  102  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.375713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  33.05 
 
 		 426 aa  102  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0698  ATPase central domain-containing protein  32.62 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.24522  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  34.68 
 
 		 648 aa  102  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  35.71 
 
 		 425 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  28.87 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  31.52 
 
 		 468 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4998  AAA ATPase central domain protein  35.89 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  30.65 
 
 		 1301 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4255  AAA ATPase, central region  35.57 
 
 		 688 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37796  predicted protein  36.19 
 
 		 636 aa  100  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10341  cell division protein FtsH4  37.76 
 
 		 575 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.194795  hitchhiker  0.000108584 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0353  peptidase M41, FtsH  37.76 
 
 		 575 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.209104  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05588  intermembrane space AAA protease IAP-1 (AFU_orthologue; AFUA_4G11530)  36.87 
 
 		 784 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.14 
 
 		 620 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  30.6 
 
 		 804 aa  98.6  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  36.32 
 
 		 650 aa  97.4  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  36.32 
 
 		 647 aa  97.4  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2275  proteasome-activating nucleotidase  33.49 
 
 		 379 aa  96.7  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.575549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.11 
 
 		 627 aa  97.1  4e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1606  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.73 
 
 		 660 aa  96.3  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3081  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.58 
 
 		 655 aa  96.7  6e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.312439  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0954  vesicle-fusing ATPase  38.67 
 
 		 650 aa  96.3  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000306538  normal  0.326508 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0783  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.01 
 
 		 631 aa  95.9  9e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000394436  unclonable  0.000000272669 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1248  26S proteasome subunit P45 family  31.84 
 
 		 393 aa  95.1  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.487515  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0830  cell division protein FtsH3  38.46 
 
 		 624 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.12 
 
 		 657 aa  95.1  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000356985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1023  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.12 
 
 		 657 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000161981  hitchhiker  0.0000832625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>