204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0360 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0360  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4886  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  26.79 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 168 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 162 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  32.43 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0284  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.141627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  34.94 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  30.43 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  24.71 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.87 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1159  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.462298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  37.89 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 176 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  28 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 146 aa  47.8  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  29.82 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  34.88 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 326 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  29.1 
 
 		 174 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  31.54 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4762  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5619  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 		 134 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966893  hitchhiker  0.00498521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0820  putative MarR-family regulatory protein  34.48 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  27.96 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  35.64 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 336 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 326 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 136 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0683  transcriptional regulator, MarR family protein  25.52 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157665  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 321 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 160 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 152 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6509  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.248842 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 137 aa  44.7  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  34.02 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 158 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  38.03 
 
 		 161 aa  44.7  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 147 aa  44.3  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 137 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  29.3 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.58 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1741  putative MarR-family regulatory protein  32.93 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1381  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  23.42 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  23.78 
 
 		 175 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  29.73 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>