128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18960 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  352  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  46.2 
 
 		 188 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  43.53 
 
 		 177 aa  140  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6171  Transcriptional regulators-like protein  36.36 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1098  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 171 aa  84.7  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7490  hypothetical protein  34.67 
 
 		 190 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0307768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7500  hypothetical protein  34.67 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 151 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30.91 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  37.04 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 147 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 		 156 aa  49.3  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.06 
 
 		 148 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 148 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 148 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 151 aa  45.8  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  34.67 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 147 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 147 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 173 aa  44.7  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2359  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 176 aa  44.7  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0133707  normal  0.534803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 152 aa  44.3  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 152 aa  44.3  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 164 aa  44.3  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  36.9 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  31.19 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 166 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  26.85 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  25.42 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2739  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 144 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 147 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30.77 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 149 aa  42  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 147 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30.77 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.77 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  30.77 
 
 		 145 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 162 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 		 166 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 167 aa  42  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 149 aa  42  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000000201551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 		 162 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1592  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 304 aa  42  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0532297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 146 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>