270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3258 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3485  chitinase  89.26 
 
 		 539 aa  913    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  65.53 
 
 		 536 aa  661    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 540 aa  1091    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  70.6 
 
 		 532 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  64.48 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  75.68 
 
 		 662 aa  568  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  69.92 
 
 		 651 aa  553  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  72.01 
 
 		 792 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  67.42 
 
 		 540 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  49.76 
 
 		 521 aa  357  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  47.2 
 
 		 703 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  33.75 
 
 		 559 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  41 
 
 		 430 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  38.21 
 
 		 652 aa  243  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  36.12 
 
 		 762 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  35.71 
 
 		 400 aa  211  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  34.79 
 
 		 1271 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  36.93 
 
 		 425 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  36.45 
 
 		 854 aa  193  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  34.76 
 
 		 414 aa  193  8e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  32.84 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  34.48 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  33.09 
 
 		 451 aa  182  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  28.52 
 
 		 868 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  32.74 
 
 		 586 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  28.14 
 
 		 868 aa  171  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.66 
 
 		 868 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  27.42 
 
 		 869 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  27.26 
 
 		 868 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  27.26 
 
 		 868 aa  166  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  27.95 
 
 		 868 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  32.13 
 
 		 763 aa  163  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  27.7 
 
 		 563 aa  163  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 472 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  27.21 
 
 		 867 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  31.26 
 
 		 674 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  31.02 
 
 		 674 aa  160  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  31.02 
 
 		 674 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  31.02 
 
 		 674 aa  160  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  31.09 
 
 		 674 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  30.86 
 
 		 674 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  30.86 
 
 		 674 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 674 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  31.49 
 
 		 674 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  31.49 
 
 		 674 aa  157  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  31.03 
 
 		 674 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  27.16 
 
 		 863 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  31.76 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  29.26 
 
 		 972 aa  151  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.65 
 
 		 675 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  28.88 
 
 		 848 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  27.64 
 
 		 855 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  30.32 
 
 		 639 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  31.83 
 
 		 398 aa  146  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  27.94 
 
 		 848 aa  144  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1080 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.13 
 
 		 482 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  31.52 
 
 		 431 aa  138  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  31.51 
 
 		 396 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 		 652 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  28.99 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 		 1578 aa  124  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  28.77 
 
 		 373 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  29.7 
 
 		 505 aa  118  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  28.53 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.17 
 
 		 1362 aa  113  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  34.16 
 
 		 468 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  29.23 
 
 		 401 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  30.41 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  26.87 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  44.22 
 
 		 552 aa  106  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  42.42 
 
 		 613 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  26.98 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  47.33 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  27.42 
 
 		 407 aa  103  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.06 
 
 		 465 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  25.3 
 
 		 499 aa  102  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 		 364 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  28.95 
 
 		 366 aa  97.4  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  30.53 
 
 		 861 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2285  glycoside hydrolase family protein  42.71 
 
 		 462 aa  92  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2410  glycoside hydrolase family protein  37.88 
 
 		 459 aa  90.9  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.840511  normal  0.905848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  29.12 
 
 		 382 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  40.78 
 
 		 514 aa  88.6  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  27.2 
 
 		 997 aa  85.9  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.14 
 
 		 1132 aa  84.7  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  38.46 
 
 		 507 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  27.86 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  24.47 
 
 		 634 aa  84.3  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  27.86 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  27.86 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  28 
 
 		 699 aa  83.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 		 355 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  27.55 
 
 		 699 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  38.1 
 
 		 637 aa  79  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  28.62 
 
 		 563 aa  77  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12018  chitinase  35.66 
 
 		 142 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 		 1782 aa  75.5  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  27.22 
 
 		 827 aa  74.3  0.000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  26.77 
 
 		 1146 aa  73.9  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>