More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6637 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6637  response regulator receiver protein  100 
 
 		 222 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4531  transcriptional regulator, LuxR family  34.93 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.77 
 
 		 1021 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  31.03 
 
 		 1187 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2681  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 74 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0827  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0526  hypothetical protein  41.94 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00310  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.86 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0513  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.52986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  32.41 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4044  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.64 
 
 		 702 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246164  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0928  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2141  hypothetical protein  40 
 
 		 277 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0962248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0795  transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 983 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1269  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.55 
 
 		 509 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  24.18 
 
 		 793 aa  52  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.28 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4606  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.296562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 915 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0907  ATP-dependent transcription regulator LuxR  37.97 
 
 		 850 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2613  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.31 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 368 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3279  response regulator receiver  39.71 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.97215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3511  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 904 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1253  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.78 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 1516 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.77 
 
 		 1147 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.89 
 
 		 1557 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1757  transcriptional regulator, LuxR family  32.88 
 
 		 993 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.790916  normal  0.333807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 877 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0637  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.565019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0799  response regulator receiver protein  43.75 
 
 		 204 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 		 918 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0236  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.31 
 
 		 224 aa  48.9  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1370  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 881 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1388  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 881 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0315811  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1964  transcriptional regulator, LuxR family  27.95 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.666792  normal  0.751243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19250  transcriptional regulator, LuxR family  48.08 
 
 		 894 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.368916  normal  0.454776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1404  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 876 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5633  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.603295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4439  LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  37.63 
 
 		 956 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  43.55 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.79 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6351  two component LuxR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27950  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.15 
 
 		 923 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.81499  normal  0.031015 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1626  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 194 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.947018 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  45.61 
 
 		 919 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.78 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4160  transcriptional regulator, LuxR family  49.21 
 
 		 872 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  42.25 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0377  transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 134 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.48 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  35.35 
 
 		 909 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  40.74 
 
 		 910 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.39 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0415698  normal  0.590713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0610  LuxR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.317613 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.34 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2087  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.73112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5878  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 441 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.464013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1228  LuxR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2364  transcriptional regulator, LuxR family  27.33 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.461872  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.19 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1688  response regulator receiver protein  33.7 
 
 		 385 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4439  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4199  regulatory protein, LuxR  45.16 
 
 		 855 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  42.62 
 
 		 309 aa  47  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1161  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.675286  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  40.32 
 
 		 917 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4344  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.218307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.18 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 230 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2457  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 554 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02220  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 862 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.591408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.65 
 
 		 258 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4161  regulatory protein LuxR  45.1 
 
 		 893 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.339617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4422  ATP-dependent transcription regulator LuxR  38.81 
 
 		 905 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0079  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0793395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1000  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0913  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1539  LuxR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 319 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.98 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4238  transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 919 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.5259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2876  response regulator receiver  42.25 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>