140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4561 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4561  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  615  1e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0028561  normal  0.0291759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7182  hypothetical protein  85.12 
 
 		 289 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.0722414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19640  site-specific recombinase XerD  47.44 
 
 		 324 aa  255  6e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0211169  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4226  RNA polymerase sigma factor containing a TPR repeat domain-like protein  42.13 
 
 		 680 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  0.0144943 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0869  putative RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  43.53 
 
 		 651 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456252  normal  0.192635 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  28.57 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5207  hypothetical protein  36.84 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.284913  normal  0.803536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  23.83 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  23.93 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  21.71 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  29.67 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  27.87 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3097  site-specific recombinase XerD-like protein  26.44 
 
 		 205 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  27.84 
 
 		 390 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4785  integrase family protein  30.29 
 
 		 284 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000301446  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  26.3 
 
 		 309 aa  53.5  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2216  integrase family protein  24.64 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000229864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3694  integrase family protein  25.39 
 
 		 348 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  25.42 
 
 		 415 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  25.42 
 
 		 415 aa  52.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 293 aa  52.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  25.42 
 
 		 399 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 		 317 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  24.17 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.07 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4666  hypothetical protein  42.86 
 
 		 245 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.07 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  22.4 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.42 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  28.11 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  21.43 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  27.31 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  27.31 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0900  integrase  21.93 
 
 		 322 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000819417  hitchhiker  0.000000626468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  34.21 
 
 		 310 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  25.26 
 
 		 295 aa  50.1  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  27.31 
 
 		 304 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1628  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 182 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  26.76 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  30.13 
 
 		 313 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  28.57 
 
 		 332 aa  49.3  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23.59 
 
 		 294 aa  49.3  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  26.01 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  20.98 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  23 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1515  integrase family protein  24.48 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0004  phage integrase family site specific recombinase  26.19 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 295 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  26.54 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1994  integrase family protein  24.79 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000947418  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  23 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1434  phage integrase family protein  22.4 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  24.41 
 
 		 412 aa  47.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  33.54 
 
 		 297 aa  47.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  26.04 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  19.7 
 
 		 290 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  26.79 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  28.57 
 
 		 400 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 301 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  29.41 
 
 		 307 aa  46.6  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  25.34 
 
 		 289 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  31.76 
 
 		 314 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.67 
 
 		 307 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1181  integrase family protein  27.01 
 
 		 417 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588038 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  22.52 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 		 299 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  30.9 
 
 		 304 aa  45.8  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 298 aa  45.8  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  26.72 
 
 		 330 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  24.75 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0586  site-specific recombinase, phage integrase family  25.4 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.243719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  28.4 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  19.7 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.78 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  26.63 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  25.43 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  29.51 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.84 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  27.78 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3501  integrase family protein  25.67 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1585  phage integrase  26.88 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.791115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  27.57 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.07 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  27.24 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  21.97 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.84 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  27.32 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>