More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4095 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4095  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
333 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6203  DeoR family transcriptional regulator  60.19 
 
 
318 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0920  Helix-turn-helix type 11 domain protein  57.06 
 
 
327 aa  318  5e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.711136  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2098  Helix-turn-helix type 11 domain protein  58.99 
 
 
318 aa  316  4e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5463  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  56.33 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1047  DeoR family transcriptional regulator  58.58 
 
 
322 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0554838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8630  DeoR family transcriptional regulator  55.99 
 
 
322 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5326  DeoR family transcriptional regulator  54.75 
 
 
318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.563326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4172  Helix-turn-helix type 11 domain protein  56.77 
 
 
317 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.917159  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1446  putative transcriptional regulator  52.01 
 
 
332 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00684408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4133  DeoR family transcriptional regulator  54.95 
 
 
317 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.113991  normal  0.040793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4041  Helix-turn-helix type 11 domain protein  57.39 
 
 
316 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0249  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  50.16 
 
 
324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0977  DeoR family transcriptional regulator  52.49 
 
 
360 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226699  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5212  Helix-turn-helix type 11 domain protein  54.4 
 
 
317 aa  277  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000701081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2974  DeoR family transcriptional regulator  51.74 
 
 
319 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  0.781562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0284  Helix-turn-helix type 11 domain protein  54.23 
 
 
332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.527195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3867  Helix-turn-helix type 11 domain protein  52.53 
 
 
335 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4549  Helix-turn-helix type 11 domain protein  53.85 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5106  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  48.42 
 
 
319 aa  266  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.505458  normal  0.201643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4377  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  52 
 
 
320 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000417511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4738  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  47.71 
 
 
313 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.947562  normal  0.956989 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1067  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  51.69 
 
 
320 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4323  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  50 
 
 
327 aa  262  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.807083  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1247  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  47 
 
 
317 aa  255  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.161645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0988  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  46.52 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0960  helix-turn-helix, type 11  45.89 
 
 
317 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0978  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  45.89 
 
 
317 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318116  normal  0.0703128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2690  Helix-turn-helix type 11 domain protein  53.4 
 
 
324 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.113203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3107  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.02 
 
 
324 aa  245  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.786544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2906  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.83 
 
 
334 aa  241  9e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.754227  normal  0.106292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0206  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.08 
 
 
318 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0242006 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0728  Helix-turn-helix type 11 domain protein  48.7 
 
 
320 aa  232  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0343  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.95 
 
 
339 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3135  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.65 
 
 
329 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.224168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3513  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.06 
 
 
322 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188923  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0367  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.18 
 
 
335 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4787  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  45.86 
 
 
336 aa  225  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.287509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5404  DeoR family transcriptional regulator  46.33 
 
 
332 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924628  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0094  Helix-turn-helix type 11 domain protein  47.37 
 
 
325 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3338  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.34 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5244  DeoR family transcriptional regulator  47.94 
 
 
337 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.288323 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0153  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.63 
 
 
325 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3486  Helix-turn-helix type 11 domain protein  49.54 
 
 
314 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02350  predicted transcriptional regulator  45.15 
 
 
327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3293  Helix-turn-helix type 11 domain protein  46.44 
 
 
327 aa  212  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0990426  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8641  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.45 
 
 
320 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.160159  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2064  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.25 
 
 
337 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.600491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0463  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.55 
 
 
334 aa  205  9e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.104964  normal  0.0170301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1998  Helix-turn-helix type 11 domain protein  44.38 
 
 
334 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.556593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2870  Helix-turn-helix type 11 domain protein  45.7 
 
 
326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.308782  normal  0.417493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1359  Helix-turn-helix type 11 domain protein  49.02 
 
 
322 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1347  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  50 
 
 
339 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.469049  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17920  predicted transcriptional regulator  44.2 
 
 
238 aa  159  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.384504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2888  Helix-turn-helix type 11 domain protein  52.82 
 
 
317 aa  159  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0147  helix-turn-helix, type 11  35.56 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45460  hypothetical protein  37.38 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1789  Helix-turn-helix type 11 domain protein  38.34 
 
 
333 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0003326  normal  0.195591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4059  helix-turn-helix, type 11  36.81 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.348793  normal  0.0202879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1946  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.65 
 
 
321 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3412  Helix-turn-helix type 11 domain protein  37.85 
 
 
324 aa  135  7.000000000000001e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380317  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3859  hypothetical protein  36.25 
 
 
323 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0713  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.91 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.677583  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1870  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.03 
 
 
337 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.199317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2627  Helix-turn-helix type 11 domain protein  42.23 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00443  repressor  37.5 
 
 
322 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0287725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0327  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.32 
 
 
339 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489263  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2021  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.46 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0370713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3440  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.34 
 
 
336 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000171457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000786  predicted transcriptional regulator  34.98 
 
 
228 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0574064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2857  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.37 
 
 
326 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0404483  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3039  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.11 
 
 
235 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545561  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1731  DeoR family transcriptional regulator  28.9 
 
 
230 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.590959  normal  0.873384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4645  helix-turn-helix, type 11  30.1 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1647  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.44 
 
 
299 aa  98.2  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0680  DeoR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
231 aa  94.7  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3679  Helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  33.49 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0370855  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1289  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.25 
 
 
315 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.447111 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2785  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.17 
 
 
229 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.899973 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0679  helix-turn-helix, type 11  34.74 
 
 
237 aa  92.8  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.43 
 
 
228 aa  92.8  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0941  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  28.9 
 
 
230 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.958625  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0510  helix-turn-helix, type 11  31.78 
 
 
230 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2755  Helix-turn-helix type 11 domain protein  31.34 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4654  hypothetical protein  27.8 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000770885  unclonable  9.19298e-26 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0456  helix-turn-helix, type 11  31.78 
 
 
230 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0450  HTH domain-containing protein  31.78 
 
 
230 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2492  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.52 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156303  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3400  hypothetical protein  31.34 
 
 
226 aa  90.1  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2507  Helix-turn-helix type 11 domain protein  34.83 
 
 
321 aa  90.1  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3846  Helix-turn-helix type 11 domain protein  30.2 
 
 
230 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80209  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0562  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  27.32 
 
 
317 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.349747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0615  hypothetical protein  27.32 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.759398  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0705  hypothetical protein  27.32 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0648  hypothetical protein  27.32 
 
 
317 aa  89.7  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0266881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3646  Helix-turn-helix type 11 domain protein  29.3 
 
 
309 aa  89.7  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000392325  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0104  hypothetical protein  33 
 
 
230 aa  89.4  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4104  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  34.4 
 
 
316 aa  89.4  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0777  hypothetical protein  27.32 
 
 
317 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.845326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0560  transcriptional regulator  27.32 
 
 
317 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00184479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>