More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3756 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  100 
 
 		 514 aa  1021    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  39.31 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  36.59 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  34.7 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  31.24 
 
 		 538 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  31.93 
 
 		 496 aa  187  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  30.72 
 
 		 533 aa  183  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 		 539 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 525 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  29.89 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  29.57 
 
 		 540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  29.85 
 
 		 513 aa  174  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 540 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  27.79 
 
 		 522 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 518 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  29.18 
 
 		 512 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  27.69 
 
 		 538 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  28.46 
 
 		 545 aa  166  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  28.46 
 
 		 545 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  27.38 
 
 		 538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  26.92 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 517 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  27.94 
 
 		 529 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.61 
 
 		 535 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  27.62 
 
 		 529 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 527 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  27.37 
 
 		 527 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  27.37 
 
 		 527 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  30.33 
 
 		 538 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 		 527 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 519 aa  156  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 527 aa  156  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 		 519 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 527 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  30.02 
 
 		 524 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  27.17 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 536 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 527 aa  150  7e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  30.7 
 
 		 526 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  31.68 
 
 		 505 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 509 aa  146  8.000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 532 aa  146  9e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 535 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 536 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  26.91 
 
 		 536 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 535 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 515 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.64 
 
 		 526 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 535 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  26.76 
 
 		 537 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 550 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  28.48 
 
 		 512 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.55 
 
 		 510 aa  131  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  28.75 
 
 		 516 aa  130  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 561 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 523 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  25.4 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3863  extracellular solute-binding protein family 5  32.2 
 
 		 523 aa  127  5e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00142419 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1933  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 510 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 505 aa  124  6e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  25.14 
 
 		 554 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 534 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0469  extracellular solute-binding protein family 5  33.59 
 
 		 554 aa  120  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.208856 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 537 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25 
 
 		 540 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.5 
 
 		 507 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3437  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 492 aa  113  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58601  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.08 
 
 		 511 aa  113  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1284  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.44 
 
 		 545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000669385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.78 
 
 		 518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 519 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.75 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.04 
 
 		 554 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2767  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 555 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3152  extracellular solute-binding protein family 5  32.02 
 
 		 506 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.79 
 
 		 524 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0645  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3126  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 510 aa  110  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  31.07 
 
 		 519 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.08 
 
 		 532 aa  110  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.36 
 
 		 516 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2659  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1571  4-phytase  28.22 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.624152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 512 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3773  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434805  normal  0.505457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>