More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0270 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  100 
 
 		 243 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  68.94 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  69.4 
 
 		 247 aa  299  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  60.58 
 
 		 243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  69.48 
 
 		 224 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  58.01 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  59.91 
 
 		 245 aa  268  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  60.96 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  57.81 
 
 		 252 aa  265  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  56.48 
 
 		 264 aa  262  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  57.61 
 
 		 279 aa  261  4.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  55.27 
 
 		 269 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  56.88 
 
 		 445 aa  260  1e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  56 
 
 		 455 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.71 
 
 		 264 aa  259  3e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  53.62 
 
 		 277 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  60.83 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  56.17 
 
 		 266 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  59.45 
 
 		 253 aa  254  8e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  58.65 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  58.16 
 
 		 241 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  54.11 
 
 		 262 aa  252  4.0000000000000004e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  56.42 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  54.35 
 
 		 263 aa  251  1e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  58.06 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  58.68 
 
 		 258 aa  249  4e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  56.7 
 
 		 244 aa  248  7e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  52.59 
 
 		 255 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  52.32 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  52.63 
 
 		 279 aa  247  1e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  54.43 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  54.82 
 
 		 258 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.31 
 
 		 280 aa  245  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  51.93 
 
 		 266 aa  244  6e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 302 aa  244  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  54.98 
 
 		 255 aa  244  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  51.75 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  55.3 
 
 		 258 aa  241  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  58.06 
 
 		 257 aa  242  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  56.62 
 
 		 258 aa  241  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  57.64 
 
 		 272 aa  241  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  57.73 
 
 		 255 aa  239  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  54.35 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  59.33 
 
 		 268 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  57.42 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  53.88 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  57.77 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  54.1 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  56.9 
 
 		 277 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  58.64 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.72 
 
 		 269 aa  232  5e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  55.5 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  60.76 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  53.88 
 
 		 256 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  56.44 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  54.84 
 
 		 274 aa  225  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 255 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  57.14 
 
 		 312 aa  222  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  53 
 
 		 255 aa  222  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.44 
 
 		 245 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  56.22 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 279 aa  218  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  51.74 
 
 		 293 aa  210  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  44.09 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  51.68 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  48.43 
 
 		 252 aa  204  8e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  55.14 
 
 		 247 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  48.29 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.1 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  43.98 
 
 		 240 aa  199  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2408  ABC transporter related  51.98 
 
 		 219 aa  199  5e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000980681 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  44.5 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  52.04 
 
 		 249 aa  198  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  49.75 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  44.7 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  44.89 
 
 		 235 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3166  ABC transporter related protein  52.66 
 
 		 240 aa  195  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.240946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  40.91 
 
 		 256 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  44.06 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0819  ABC transporter related  44.1 
 
 		 231 aa  194  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974524 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 248 aa  195  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.04 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  47.24 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  46.73 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  40.49 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  46.58 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  38.53 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0535  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  39.22 
 
 		 255 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  47.73 
 
 		 241 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2439  ABC transporter related  49.03 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.110449  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2956  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000801785  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  41.32 
 
 		 641 aa  190  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2214  ABC transporter, ATPase subunit  50.26 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0321  ABC transporter related  44.09 
 
 		 227 aa  190  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  48.53 
 
 		 233 aa  189  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>