More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5083 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 196 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  51.28 
 
 		 195 aa  171  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  44.5 
 
 		 202 aa  164  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 198 aa  164  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 221 aa  157  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  45.64 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  45.64 
 
 		 198 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 269 aa  135  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 236 aa  134  9e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 233 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 199 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 199 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  36.17 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 342 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  37.95 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 213 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 212 aa  124  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 213 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 260 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 207 aa  111  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  35.06 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 198 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  35.08 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 197 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  48.39 
 
 		 211 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 198 aa  72  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  23.84 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  23.2 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0010  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  25 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  19.69 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>