254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1590 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1590  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  831    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3922  hypothetical protein  55.74 
 
 
459 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0110065  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3912  hypothetical protein  53.19 
 
 
415 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0491324  normal  0.116114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0846  hypothetical protein  47.99 
 
 
467 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.421105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0903  hypothetical protein  45.76 
 
 
466 aa  340  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1479  hypothetical protein  35.97 
 
 
440 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000468509  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08420  hypothetical protein  33.11 
 
 
450 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0686  protein of unknown function DUF58  37.45 
 
 
434 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3075  protein of unknown function DUF58  29.38 
 
 
520 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107582 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13184  hypothetical protein  30.79 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0475  hypothetical protein  29.54 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.916788  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0155  hypothetical protein  30.19 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0164  hypothetical protein  30.19 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.136882  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0145  hypothetical protein  30.19 
 
 
408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2871  protein of unknown function DUF58  32.17 
 
 
446 aa  116  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.547969  normal  0.051517 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1788  protein of unknown function DUF58  29.51 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0232478  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3412  protein of unknown function DUF58  31.84 
 
 
455 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.228711  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0181  hypothetical protein  30.53 
 
 
405 aa  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.218167  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  20.1 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1282  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
430 aa  91.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0117849  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  26.99 
 
 
458 aa  86.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0344  protein of unknown function DUF58  30.3 
 
 
391 aa  86.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.396918  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18610  hypothetical protein  29.88 
 
 
449 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2414  normal  0.348179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  31.82 
 
 
447 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  32.4 
 
 
443 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  32.42 
 
 
429 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  31.84 
 
 
443 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  27.44 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  32.45 
 
 
444 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2373  protein of unknown function DUF58  30.72 
 
 
575 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3321  hypothetical protein  30.98 
 
 
443 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3183  hypothetical protein  29.52 
 
 
419 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.89 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  27.84 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2137  hypothetical protein  22.35 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  29.28 
 
 
440 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  28.8 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0108  conserved repeat domain protein  28.07 
 
 
641 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2911  hypothetical protein  26.98 
 
 
419 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  27.54 
 
 
440 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  35.84 
 
 
473 aa  63.9  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  27.78 
 
 
295 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  31.1 
 
 
340 aa  63.2  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  32.67 
 
 
430 aa  63.2  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  37.5 
 
 
340 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  26.24 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  24.93 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20700  hypothetical protein  31.62 
 
 
432 aa  61.6  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2039  protein of unknown function DUF58  28.16 
 
 
528 aa  60.5  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  29.17 
 
 
296 aa  60.8  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  28.53 
 
 
638 aa  60.5  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  27.15 
 
 
432 aa  59.7  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1714  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 
469 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.155953  hitchhiker  0.00648309 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  32.28 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0086  protein of unknown function DUF58  33.06 
 
 
298 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.153516  normal  0.0632534 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  31.17 
 
 
316 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05146  hypothetical protein  25 
 
 
308 aa  59.7  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  25.58 
 
 
287 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  26.23 
 
 
295 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3576  protein of unknown function DUF58  29.61 
 
 
444 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.22964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  29.46 
 
 
433 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  22.27 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0400  protein of unknown function DUF58  25.9 
 
 
505 aa  58.2  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  29.6 
 
 
320 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001271  hypothetical protein  26.72 
 
 
308 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.319141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1323  protein of unknown function DUF58  28.1 
 
 
283 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  32.82 
 
 
430 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4966  protein of unknown function DUF58  26.56 
 
 
450 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000197556  hitchhiker  0.000000000000243349 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  26.84 
 
 
287 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.46 
 
 
303 aa  57.8  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  24.19 
 
 
446 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0465  conserved repeat domain protein  29.37 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1746  ATPase  35 
 
 
328 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2966  hypothetical protein  27.02 
 
 
436 aa  57.4  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.436518  normal  0.0431026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1479  hypothetical protein  28.46 
 
 
291 aa  57.4  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.760748  normal  0.45052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  34.13 
 
 
430 aa  57  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1946  hypothetical protein  40.68 
 
 
312 aa  57.4  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2079  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  57  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.48 
 
 
290 aa  57  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3127  protein of unknown function DUF58  30.42 
 
 
444 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.427692 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  25.87 
 
 
288 aa  56.6  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0526  hypothetical protein  38.1 
 
 
319 aa  56.6  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  29.73 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.67 
 
 
291 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2648  hypothetical protein  21.3 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1682  hypothetical protein  29.63 
 
 
287 aa  55.1  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.371419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  23.67 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.64 
 
 
302 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  35.48 
 
 
317 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0252  hypothetical protein  30.77 
 
 
294 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0034  conserved repeat domain protein  25 
 
 
451 aa  54.7  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.559435  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  27.15 
 
 
314 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  37.33 
 
 
312 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4421  hypothetical protein  26.85 
 
 
309 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  25.29 
 
 
296 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  24.59 
 
 
419 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  35.9 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  24.44 
 
 
296 aa  54.3  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09793  hypothetical protein  23.08 
 
 
443 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0685361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  26.07 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>