More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0064 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  51.7 
 
 		 1111 aa  1012    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  50.13 
 
 		 1172 aa  1003    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  44.62 
 
 		 1120 aa  853    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 1100 aa  2206    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 1138 aa  986    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  51.23 
 
 		 1113 aa  994    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 1112 aa  1016    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  56.6 
 
 		 1094 aa  1058    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 1112 aa  1016    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  51.73 
 
 		 1100 aa  1035    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  45.68 
 
 		 1147 aa  858    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  54.85 
 
 		 1098 aa  1114    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  51.62 
 
 		 1101 aa  1041    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2881  lysyl-tRNA synthetase  62.06 
 
 		 496 aa  625  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.075021  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9155  lysyl-tRNA synthetase  60.76 
 
 		 500 aa  614  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4482  lysyl-tRNA synthetase  60.86 
 
 		 499 aa  610  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4987  lysyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 		 500 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.771259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8377  lysyl-tRNA synthetase  57.88 
 
 		 506 aa  595  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3422  lysyl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 499 aa  593  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.316072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16450  lysyl-tRNA synthetase  59.14 
 
 		 499 aa  584  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0216  lysyl-tRNA synthetase  55.97 
 
 		 501 aa  546  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404886  normal  0.127983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0855  lysyl-tRNA synthetase  53.59 
 
 		 504 aa  531  1e-149  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4277  lysyl-tRNA synthetase  53.68 
 
 		 502 aa  527  1e-148  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.654573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0637  lysyl-tRNA synthetase  52.86 
 
 		 528 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4711  lysyl-tRNA synthetase  53.04 
 
 		 502 aa  516  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243441  hitchhiker  0.000510854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4347  lysyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31970  lysyl-tRNA synthetase (class II)  51.79 
 
 		 510 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0329  lysyl-tRNA synthetase  50.7 
 
 		 503 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0641  lysyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 495 aa  482  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2092  lysyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 515 aa  478  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0720  lysyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 503 aa  469  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  0.145533 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0165  lysyl-tRNA synthetase  48.26 
 
 		 510 aa  468  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6309  lysyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 501 aa  469  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0576  lysyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1487  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12890  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.9 
 
 		 502 aa  464  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0133257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  45.56 
 
 		 592 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0329  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4758  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.38099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4844  lysyl-tRNA synthetase  49.3 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2977  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 		 504 aa  457  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.120285  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5144  lysyl-tRNA synthetase  49.1 
 
 		 512 aa  456  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24660  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 520 aa  441  9.999999999999999e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4000  lysyl-tRNA synthetase  47.7 
 
 		 507 aa  438  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01510  lysyl-tRNA synthetase  47.44 
 
 		 504 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5360  lysyl-tRNA synthetase  48.06 
 
 		 509 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.370612  normal  0.216522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13631  lysyl-tRNA synthetase  48.99 
 
 		 505 aa  433  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.57395e-59  normal  0.0200312 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1428  lysyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 501 aa  429  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.680622  normal  0.318104 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0393  lysine--tRNA ligase  43.88 
 
 		 565 aa  413  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 		 497 aa  413  1e-114  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 1118 aa  413  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1129  lysyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 502 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0254067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1001  lysyl-tRNA synthetase  44.06 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000393607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 489 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 489 aa  400  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 494 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 573 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1485  lysyl-tRNA synthetase  43.4 
 
 		 562 aa  401  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  44.15 
 
 		 494 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  44.86 
 
 		 501 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 499 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 		 499 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 573 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 499 aa  399  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  43.63 
 
 		 491 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 499 aa  399  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 499 aa  399  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 499 aa  399  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 561 aa  399  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1357  lysyl-tRNA synthetase  45.27 
 
 		 501 aa  398  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 499 aa  399  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1154  lysyl-tRNA synthetase  43.04 
 
 		 509 aa  397  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 499 aa  399  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 499 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 499 aa  399  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  41.65 
 
 		 573 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18071  lysyl-tRNA synthetase  42.77 
 
 		 512 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.66414  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 499 aa  394  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 499 aa  396  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13230  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.96 
 
 		 771 aa  394  1e-108  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0295969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 495 aa  392  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1187  lysyl-tRNA synthetase  41.81 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33244  normal  0.0846582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  44.2 
 
 		 495 aa  392  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 502 aa  393  1e-107  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  44.08 
 
 		 504 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1378  lysyl-tRNA synthetase  42.71 
 
 		 502 aa  393  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1733  lysyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 		 511 aa  390  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 		 493 aa  390  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1777  lysyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 560 aa  391  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105014  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 508 aa  391  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  52.73 
 
 		 578 aa  389  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 515 aa  389  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 508 aa  388  1e-106  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  42.65 
 
 		 515 aa  389  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  42.98 
 
 		 488 aa  390  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 1132 aa  388  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 503 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0159  lysyl-tRNA synthetase  42.19 
 
 		 502 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 503 aa  386  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>