124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2476 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  100 
 
 
578 aa  1140    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  47.4 
 
 
592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
1113 aa  430  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  48.96 
 
 
1100 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  53.07 
 
 
1098 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
1172 aa  382  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
1101 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 
1094 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  50.41 
 
 
1100 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
1111 aa  361  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
1112 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  42.04 
 
 
1112 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  41.95 
 
 
701 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  42.98 
 
 
643 aa  339  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  44.64 
 
 
656 aa  338  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  41.81 
 
 
1147 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  40.73 
 
 
1120 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  43.76 
 
 
599 aa  320  3e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
1138 aa  300  5e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  33.27 
 
 
917 aa  291  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  39.37 
 
 
1132 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  38.56 
 
 
1118 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  31.81 
 
 
597 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0378  protein of unknown function DUF470  38.36 
 
 
938 aa  176  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.173445  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  25.41 
 
 
556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  25.41 
 
 
556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  25.83 
 
 
556 aa  140  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  32.93 
 
 
484 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  22.74 
 
 
813 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  30.48 
 
 
875 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  26.3 
 
 
863 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  23.72 
 
 
839 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  29.64 
 
 
869 aa  108  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  26.17 
 
 
857 aa  106  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  25.74 
 
 
858 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  30.77 
 
 
880 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  27.78 
 
 
850 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  26.69 
 
 
880 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  26.47 
 
 
723 aa  104  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  24.28 
 
 
861 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  25 
 
 
863 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  24.28 
 
 
861 aa  103  8e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  24.28 
 
 
861 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  28.75 
 
 
879 aa  103  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.28 
 
 
861 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  24.28 
 
 
861 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.2 
 
 
851 aa  103  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  24.71 
 
 
905 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  24.85 
 
 
861 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.28 
 
 
859 aa  103  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  24.28 
 
 
859 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  30.92 
 
 
880 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  31.62 
 
 
883 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  24.28 
 
 
861 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  29.76 
 
 
877 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  23.99 
 
 
861 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  29.76 
 
 
877 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  30.92 
 
 
880 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  21.48 
 
 
862 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  30.6 
 
 
880 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  27.91 
 
 
854 aa  100  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2131  hypothetical protein  24.6 
 
 
847 aa  100  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  26.14 
 
 
880 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  21.39 
 
 
852 aa  99  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  24.62 
 
 
590 aa  98.6  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  31.07 
 
 
854 aa  97.4  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  22.78 
 
 
569 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3871  hypothetical protein  28.22 
 
 
889 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4498  hypothetical protein  28.22 
 
 
889 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5804  hypothetical protein  28.22 
 
 
889 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  29.93 
 
 
881 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  25.08 
 
 
568 aa  94  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  23.39 
 
 
395 aa  94  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  28.48 
 
 
876 aa  94  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1351  hypothetical protein  26.73 
 
 
864 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.880074  normal  0.100606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  29.93 
 
 
881 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  28.18 
 
 
864 aa  93.6  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1675  protein of unknown function DUF470  24.18 
 
 
850 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0827883  normal  0.0257354 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0930  fmtC protein  22.31 
 
 
840 aa  92  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2788  hypothetical protein  24.18 
 
 
850 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0150407  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2691  hypothetical protein  24.11 
 
 
850 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.21157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  29.6 
 
 
855 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  30.2 
 
 
346 aa  91.7  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2233  protein of unknown function DUF470  28.57 
 
 
864 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1534  hypothetical protein  25 
 
 
850 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000274946 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  28.26 
 
 
877 aa  89.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1475  hypothetical protein  24.01 
 
 
850 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.567946  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2712  hypothetical protein  23.58 
 
 
850 aa  90.1  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4396  hypothetical protein  27.15 
 
 
864 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195504  decreased coverage  0.0070818 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3932  hypothetical protein  27.49 
 
 
864 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57988  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  27.15 
 
 
866 aa  89.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  23.28 
 
 
861 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  26.24 
 
 
872 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  23.63 
 
 
844 aa  87.8  5e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  20 
 
 
875 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  26.39 
 
 
844 aa  87.4  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  27.55 
 
 
850 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  23.65 
 
 
851 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1540  hypothetical protein  24.1 
 
 
850 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396987 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  20.88 
 
 
851 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>