267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1310 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1310  Beta-glucuronidase  100 
 
 		 588 aa  1210    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0698  beta-D-glucuronidase  51.59 
 
 		 599 aa  619  1e-176  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1330  beta-D-glucuronidase  50.84 
 
 		 596 aa  609  1e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.237196  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  49.67 
 
 		 598 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  45.54 
 
 		 603 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  45.54 
 
 		 603 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  45.38 
 
 		 603 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01586  beta-D-glucuronidase  45.38 
 
 		 603 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  45.38 
 
 		 603 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01576  hypothetical protein  45.38 
 
 		 603 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  45.38 
 
 		 603 aa  490  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  45.38 
 
 		 603 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1539  beta-D-glucuronidase  46.3 
 
 		 577 aa  488  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0549709  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  43.75 
 
 		 644 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  43.84 
 
 		 598 aa  484  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  43.99 
 
 		 601 aa  483  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  43.89 
 
 		 603 aa  480  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  41.39 
 
 		 590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  45.66 
 
 		 512 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0490  Beta-glucuronidase  37.19 
 
 		 564 aa  336  9e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1689  Beta-glucuronidase  35.86 
 
 		 563 aa  335  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0566843  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  31.08 
 
 		 558 aa  248  3e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  28.77 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  27.47 
 
 		 607 aa  188  2e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  26.98 
 
 		 604 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3352  Beta-glucuronidase  25.62 
 
 		 625 aa  184  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0530012  normal  0.948257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  25.96 
 
 		 600 aa  183  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3871  Beta-glucuronidase  26.08 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.311387 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  27.56 
 
 		 591 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  28.47 
 
 		 598 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  28.3 
 
 		 568 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2734  Beta-galactosidase  26.48 
 
 		 897 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0829  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  49.13 
 
 		 188 aa  172  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0579  Beta-glucuronidase  26.11 
 
 		 597 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3669  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 888 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.88 
 
 		 862 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1011  Beta-galactosidase  27.03 
 
 		 1019 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00111283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  26.21 
 
 		 686 aa  148  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  28.61 
 
 		 1045 aa  146  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5245  Beta-galactosidase  24.45 
 
 		 670 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1017  Beta-galactosidase  24.65 
 
 		 717 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  26.85 
 
 		 1029 aa  145  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6868  Beta-galactosidase  24.24 
 
 		 707 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4018  beta-galactosidase  23.65 
 
 		 1059 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000751059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2654  Beta-galactosidase  23.95 
 
 		 704 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0659127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.14 
 
 		 858 aa  141  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0729  beta-galactosidase  25.76 
 
 		 1023 aa  140  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0768617  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0896  beta-galactosidase  24.64 
 
 		 1017 aa  140  8.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  27.29 
 
 		 1024 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  23.23 
 
 		 894 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.02 
 
 		 1077 aa  136  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3269  Beta-galactosidase  24.34 
 
 		 1076 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00255337 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2447  Beta-galactosidase  25.29 
 
 		 677 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.17 
 
 		 743 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0534  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.09 
 
 		 1013 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1218  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.15 
 
 		 1041 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000962199  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1807  Beta-galactosidase  25.95 
 
 		 1035 aa  133  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.489965  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1366  beta-galactosidase  29.14 
 
 		 1026 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1221  beta-galactosidase  28.65 
 
 		 1455 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0154  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.67 
 
 		 1030 aa  131  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  28.11 
 
 		 1129 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  26.63 
 
 		 738 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.93 
 
 		 805 aa  131  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1917  beta-D-galactosidase  25.36 
 
 		 1044 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1559  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 1084 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000116157  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  27.6 
 
 		 1046 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4065  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 1045 aa  127  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.212111  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00275  beta-D-galactosidase  26.43 
 
 		 1041 aa  126  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1739  beta-D-galactosidase  26.06 
 
 		 1066 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000361485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.29 
 
 		 750 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  28.65 
 
 		 889 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3614  glycoside hydrolase family protein  27.08 
 
 		 1094 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2834  beta-D-galactosidase  26.06 
 
 		 1050 aa  126  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.677484  normal  0.179493 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1629  beta-D-galactosidase  26.06 
 
 		 1066 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.893337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1625  glycoside hydrolase family 42 protein  28.88 
 
 		 1084 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00573488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0368  beta-D-galactosidase  26.68 
 
 		 1024 aa  124  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000219694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00298  beta-D-galactosidase  26.68 
 
 		 1024 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000026518  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3262  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.68 
 
 		 1024 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000877394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00302  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1024 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000375259  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0408  beta-D-galactosidase  26.68 
 
 		 1024 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000144327  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02463  beta-galactosidase (Eurofung)  28.25 
 
 		 1023 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.220978 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3281  beta-D-galactosidase  26.46 
 
 		 1024 aa  123  9e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000245928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4634  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.33 
 
 		 1424 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.893507  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0715  Beta-galactosidase  28.47 
 
 		 1024 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1283  glycoside hydrolase family protein  27.15 
 
 		 987 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0998  Beta-galactosidase  25.25 
 
 		 1012 aa  121  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00145387  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.89 
 
 		 1033 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0417  beta-D-galactosidase  26.46 
 
 		 1024 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000241482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  24.43 
 
 		 824 aa  120  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 766 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1261  beta-D-galactosidase  25.85 
 
 		 1032 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000337049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1071  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.58 
 
 		 781 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0819877  normal  0.0326582 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 		 827 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 		 781 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  24.1 
 
 		 923 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 803 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4911  Beta-galactosidase  26.76 
 
 		 1003 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114803  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1044  beta-D-galactosidase  22.76 
 
 		 1031 aa  117  6e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.230358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  24.52 
 
 		 1028 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2757  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25 
 
 		 805 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000135785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>