More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6647 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  100 
 
 		 946 aa  1975    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6893  multicopper oxidase type 3  85.07 
 
 		 941 aa  1608    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.845063 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  48.99 
 
 		 809 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  35.59 
 
 		 671 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  35.59 
 
 		 652 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  35.59 
 
 		 652 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  36.12 
 
 		 656 aa  355  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  35.29 
 
 		 669 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  34.5 
 
 		 638 aa  352  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  32.71 
 
 		 680 aa  341  4e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2345  hypothetical protein  30.71 
 
 		 1064 aa  332  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  34.16 
 
 		 605 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  32.3 
 
 		 664 aa  330  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  32.04 
 
 		 657 aa  326  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  31.58 
 
 		 672 aa  324  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  32.22 
 
 		 621 aa  313  6.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  32.05 
 
 		 626 aa  311  5e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  42.82 
 
 		 705 aa  311  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  31.99 
 
 		 664 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  30.39 
 
 		 642 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  32.23 
 
 		 666 aa  304  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  38.07 
 
 		 746 aa  296  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  33.48 
 
 		 593 aa  291  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  39.08 
 
 		 871 aa  287  8e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  36.92 
 
 		 619 aa  281  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2219  CopA family copper resistance protein  40.91 
 
 		 604 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00411811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  28.85 
 
 		 569 aa  265  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2205  CopA family copper resistance protein  34.64 
 
 		 574 aa  264  6e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  37.93 
 
 		 606 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  40.38 
 
 		 566 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  38.22 
 
 		 592 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  43.42 
 
 		 572 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  35.76 
 
 		 606 aa  255  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3231  copper resistance protein A precursor  35.67 
 
 		 607 aa  251  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  40.38 
 
 		 580 aa  250  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  40.82 
 
 		 594 aa  250  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  35.64 
 
 		 589 aa  248  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  35.22 
 
 		 659 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  39.76 
 
 		 561 aa  239  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  38.59 
 
 		 579 aa  238  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  34.24 
 
 		 627 aa  238  5.0000000000000005e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  39.78 
 
 		 568 aa  236  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  35.88 
 
 		 568 aa  236  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5671  copper resistance protein A  36.19 
 
 		 605 aa  236  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.561345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  37.05 
 
 		 601 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  37.05 
 
 		 601 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  35.71 
 
 		 614 aa  234  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  42.19 
 
 		 630 aa  234  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  39.13 
 
 		 568 aa  232  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  41.01 
 
 		 621 aa  232  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  35.28 
 
 		 581 aa  231  7e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  35.01 
 
 		 637 aa  228  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  32.77 
 
 		 598 aa  228  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  38.39 
 
 		 630 aa  224  8e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  37.35 
 
 		 561 aa  224  9e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  38.79 
 
 		 584 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5100  copper-resistance protein, CopA family  38.41 
 
 		 640 aa  223  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0626586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0450  CopA family copper resistance protein  37.96 
 
 		 633 aa  222  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0656  copper resistance transmembrane protein  38.99 
 
 		 605 aa  222  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1840  copper-resistance protein, CopA family  38.49 
 
 		 604 aa  221  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71414  hitchhiker  0.0000125697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0346  CopA family copper resistance protein  36.72 
 
 		 599 aa  218  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.513863  normal  0.476726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1719  copper-resistance protein, CopA family  33.73 
 
 		 631 aa  218  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5336  copper-resistance protein, CopA family  33.73 
 
 		 631 aa  218  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1779  copper-resistance protein, CopA family  38.64 
 
 		 612 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976781  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  36.7 
 
 		 594 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0108  copper resistance protein A precursor  36.13 
 
 		 606 aa  209  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0092  CopA family copper resistance protein  37.04 
 
 		 606 aa  208  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4395  CopA family copper resistance protein  34.23 
 
 		 673 aa  206  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  34.63 
 
 		 564 aa  204  6e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  35.53 
 
 		 803 aa  204  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  39.04 
 
 		 563 aa  204  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  37.32 
 
 		 590 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  35.24 
 
 		 611 aa  201  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  36.51 
 
 		 600 aa  197  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  33.85 
 
 		 604 aa  197  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  38.41 
 
 		 556 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03132  copper resistance protein A  38.54 
 
 		 602 aa  194  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  31.03 
 
 		 605 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  33.44 
 
 		 506 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  31.94 
 
 		 504 aa  152  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  31.27 
 
 		 511 aa  150  9e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  31.48 
 
 		 565 aa  148  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  31.05 
 
 		 521 aa  146  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2925  multicopper oxidase, type 3  31.12 
 
 		 536 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.455185  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0317  hypothetical protein  31.4 
 
 		 513 aa  144  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0310  multicopper oxidase, type 3  28.99 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00058954  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  29.36 
 
 		 518 aa  135  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  29.36 
 
 		 518 aa  135  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  29.85 
 
 		 477 aa  134  6.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2381  multicopper oxidase type 3  30.28 
 
 		 576 aa  134  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0890594  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  30.67 
 
 		 515 aa  134  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  29 
 
 		 551 aa  134  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  28.42 
 
 		 527 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  31.72 
 
 		 513 aa  131  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  28.21 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  28.08 
 
 		 521 aa  129  3e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  28.08 
 
 		 478 aa  128  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  26.74 
 
 		 521 aa  122  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0212  copper resistance protein, putative  28.69 
 
 		 554 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.603214  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2311  multicopper oxidase type 3  30.47 
 
 		 640 aa  122  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>