54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2522 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2522  glycogen debranching enzyme  100 
 
 		 652 aa  1356    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0950686  normal  0.047351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3810  glycogen debranching enzyme  42.22 
 
 		 661 aa  488  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.38466 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08610  glycogen debranching enzyme, putative  40.31 
 
 		 661 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3944  glycogen debranching enzyme  41.62 
 
 		 663 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00146651  normal  0.690389 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0439  glycogen debranching protein  38.11 
 
 		 660 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0298  glycogen debranching enzyme, putative  40.56 
 
 		 668 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0115  glycogen debranching enzyme, putative  38.3 
 
 		 659 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4305  glycogen debranching enzyme  40.12 
 
 		 674 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.398353  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2589  glycogen debranching enzyme, putative  38.18 
 
 		 712 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2703  glycogen debranching enzyme  39.78 
 
 		 657 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3413  glycogen debranching enzyme  39.63 
 
 		 657 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2288  glycogen debranching enzyme  38.13 
 
 		 663 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5206  glycogen debranching enzyme  40.31 
 
 		 662 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3653  glycogen debranching enzyme-related protein (4-alpha-glucanotransferase)  37.16 
 
 		 659 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.507852  normal  0.0295807 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1575  glycogen debranching protein  38.36 
 
 		 681 aa  405  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.866543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1820  glycogen debranching enzyme  38.74 
 
 		 655 aa  405  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2343  glycogen debranching enzyme  37.52 
 
 		 651 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0213  putative glycogen debranching protein  39.2 
 
 		 660 aa  396  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7095  Amylo-alpha-16-glucosidase  39.66 
 
 		 662 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1369  glycogen debranching enzyme  36.56 
 
 		 659 aa  399  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0254  glycogen debranching enzyme, putative  39.03 
 
 		 610 aa  392  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.735444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2645  putative glycogen debranching enzyme, type  34.49 
 
 		 672 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0471  glycogen debranching enzyme  37.01 
 
 		 720 aa  379  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0780556  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2331  glycogen debranching protein  34.24 
 
 		 672 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2402  glycogen debranching enzyme  37.59 
 
 		 641 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.776408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1265  glycogen debranching enzyme, putative  37.23 
 
 		 657 aa  352  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2025  glycogen debranching protein  35.09 
 
 		 686 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.242432  normal  0.373695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1826  glycogen debranching protein  34.48 
 
 		 672 aa  346  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0277805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1681  glycogen debranching enzyme  36.17 
 
 		 678 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2540  glycogen debranching enzyme  35.72 
 
 		 678 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000573314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4614  glycogen debranching enzyme  33.62 
 
 		 687 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0143177  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3665  glycogen debranching enzyme  34.46 
 
 		 675 aa  333  5e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115982  normal  0.315429 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3772  glycogen debranching enzyme  36.54 
 
 		 693 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3715  glycogen debranching enzyme  36.36 
 
 		 692 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3855  glycogen debranching enzyme  36.3 
 
 		 693 aa  326  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196981  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1421  glycogen debranching enzyme, putative  31.96 
 
 		 611 aa  308  2.0000000000000002e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.569288  normal  0.0701501 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1969  glycogen debranching enzyme  32.21 
 
 		 614 aa  292  1e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1681  glycogen debranching protein  32.09 
 
 		 658 aa  277  4e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.304262 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0988  Amylo-alpha-16-glucosidase  31.25 
 
 		 651 aa  265  2e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0888  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.93 
 
 		 656 aa  261  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.376161  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3231  Amylo-alpha-16-glucosidase  32.36 
 
 		 659 aa  260  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.393416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  31.47 
 
 		 565 aa  207  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0851  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.03 
 
 		 1433 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.203263  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03090  Glycogen debranching enzyme, putative  23.78 
 
 		 1593 aa  76.6  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74319  glycogen debranching enzyme  25 
 
 		 1526 aa  72  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10060  glycogen debranching enzyme Gdb1, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02140)  23.32 
 
 		 1537 aa  67.8  0.0000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.633222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1366  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  25.78 
 
 		 720 aa  53.9  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.711936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1553  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  23.9 
 
 		 723 aa  51.2  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.92527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1478  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.23 
 
 		 725 aa  50.8  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1137  Amylo-alpha-16-glucosidase  27.27 
 
 		 682 aa  48.9  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  24.62 
 
 		 751 aa  48.5  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1726  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.33 
 
 		 698 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1764  Amylo-alpha-16-glucosidase  21.77 
 
 		 868 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0548176  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3942  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.36 
 
 		 685 aa  43.9  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.300307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>