More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2199 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 264 aa  548  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  37.79 
 
 		 264 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1151  helix-turn-helix domain-containing protein  36.5 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2022  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0521834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0769  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 266 aa  145  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 270 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 270 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2080  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 		 271 aa  89  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.209158 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2823  transcriptional regulator, AraC family  45.69 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3380  helix-turn-helix domain-containing protein  41.82 
 
 		 288 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.84 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2046  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.344929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239018 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 345 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  40.4 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  36.26 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2786  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 409 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  37.76 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  25.61 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  35.42 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 295 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  43.04 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2746  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.902284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  39.76 
 
 		 185 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2050  AraC family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.192935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  33.08 
 
 		 346 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  32.29 
 
 		 250 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4230  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 363 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1007  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4352  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00646909  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2471  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000518709  normal  0.0153728 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1701  AraC family DNA-binding protein  37.65 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2193  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 323 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2851  transcriptional regulator with PAS/PAC sensors, AraC family  37.23 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.595855 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  26.02 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4754  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8405  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1392  transcriptional regulator  40.24 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.683187  normal  0.572085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 196 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 440 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  38.14 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6330  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.361086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  28.26 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1602  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  32.29 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2413  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4910  AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2535  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0117  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2788  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 408 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435011  hitchhiker  0.0000000035636 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1485  helix-turn-helix domain-containing protein  35.51 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.232503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 326 aa  58.9  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5046  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.311453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1891  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  34.52 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.03 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 515 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  35.16 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 334 aa  58.9  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>