More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4754 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4754  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 287 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.605594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5369  transcriptional regulator, AraC family  51.08 
 
 		 288 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.239018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2344  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.415258  decreased coverage  0.000000160682 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2295  AraC family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5735  transcriptional regulator AraC family  30.45 
 
 		 311 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1626  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 292 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.954407  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2123  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.184363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5632  DNA-binding transcriptional regulator MelR  27.17 
 
 		 302 aa  116  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03989  DNA-binding transcriptional dual regulator  26.77 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3874  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3909  DNA-binding transcriptional regulator MelR  26.77 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4584  DNA-binding transcriptional regulator MelR  26.77 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.781071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4359  DNA-binding transcriptional regulator MelR  26.77 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03950  hypothetical protein  26.77 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4672  DNA-binding transcriptional regulator MelR  26.77 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4615  DNA-binding transcriptional regulator MelR  26.77 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4643  DNA-binding transcriptional regulator MelR  27.24 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4552  DNA-binding transcriptional regulator MelR  27.24 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4643  DNA-binding transcriptional regulator MelR  27.24 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4561  DNA-binding transcriptional regulator MelR  27.24 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4692  DNA-binding transcriptional regulator MelR  27.24 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.887715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6523  transcriptional regulator, AraC family  27.76 
 
 		 306 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.399934 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6111  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 305 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.863833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5309  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.446177 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05000  response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain  25.54 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.989106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3465  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.2 
 
 		 282 aa  89.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0879036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  23.33 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  26.36 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 277 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0654  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0490278 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0345  transcriptional regulator, AraC family  24.69 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2199  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.379945  hitchhiker  0.00764507 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 287 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  20.16 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 292 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0396  AraC-like transcriptional regulator  20.95 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000261695 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  31.19 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 571 aa  58.9  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  30.28 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 519 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  30.28 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  28.44 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  41.33 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  30.28 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2411  transcriptional regulator, AraC family  27.48 
 
 		 333 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.382897  normal  0.850127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1003  transcriptional regulator, AraC family  21.45 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.23 
 
 		 1201 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  30.97 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2344  AraC family DNA-binding response regulator  29.9 
 
 		 507 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.627636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  27.52 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  29.36 
 
 		 198 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4449  AraC family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 439 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.943681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  27 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  23.36 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  30.53 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 522 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  20.68 
 
 		 300 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1597  AraC family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 283 aa  54.7  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  21.59 
 
 		 287 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 299 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2672  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  29.47 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2056  AraC family DNA-binding response regulator  29.9 
 
 		 507 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2858  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0827  AraC family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000316121  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 327 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 327 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  26.81 
 
 		 298 aa  52.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>