173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0607 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0607  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  100 
 
 
699 aa  1461    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0569988  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3616  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 
619 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.748752  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1177  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 
599 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3112  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.02 
 
 
843 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.054438  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0519  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 
619 aa  151  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1238  glycosy hydrolase family protein  24.68 
 
 
610 aa  146  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.247532  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1051  glycosy hydrolase family protein  24.46 
 
 
610 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0315037  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0488  glycoside hydrolase family protein  22.57 
 
 
626 aa  121  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0607  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 
606 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.83 
 
 
683 aa  115  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0071  N-acetyl-beta-hexosaminidase  23.71 
 
 
711 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.95 
 
 
613 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  25.53 
 
 
807 aa  110  8.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1226  glycoside hydrolase family protein  23.04 
 
 
641 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.459632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.61 
 
 
785 aa  110  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.7 
 
 
542 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.6 
 
 
797 aa  107  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.25 
 
 
765 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.36 
 
 
676 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.15 
 
 
779 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.49 
 
 
529 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  24.81 
 
 
602 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.05 
 
 
821 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.77 
 
 
781 aa  102  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1297  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 
557 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00968279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.86 
 
 
794 aa  100  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  24.7 
 
 
776 aa  100  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.93 
 
 
605 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.95 
 
 
609 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.77 
 
 
688 aa  99.4  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.8 
 
 
526 aa  98.6  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  24.46 
 
 
816 aa  98.6  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3250  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.23 
 
 
651 aa  98.6  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0167827  decreased coverage  0.00105641 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.92 
 
 
811 aa  97.8  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.14 
 
 
584 aa  97.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.24 
 
 
618 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.18 
 
 
762 aa  96.3  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.65 
 
 
593 aa  96.3  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  27.31 
 
 
558 aa  95.1  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.87 
 
 
533 aa  94.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1924  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.85 
 
 
664 aa  94.4  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234624  decreased coverage  0.00104389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.97 
 
 
634 aa  94  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  24.87 
 
 
637 aa  93.2  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  25.36 
 
 
639 aa  93.6  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.48 
 
 
775 aa  92.8  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3073  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  22.8 
 
 
591 aa  92.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.72 
 
 
613 aa  91.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.58 
 
 
760 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  24.82 
 
 
777 aa  90.9  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  26.69 
 
 
525 aa  90.9  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1815  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.89 
 
 
728 aa  90.9  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0101329  normal  0.0951479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.25 
 
 
546 aa  90.5  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  24.29 
 
 
639 aa  90.5  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.81 
 
 
795 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.71 
 
 
553 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.58 
 
 
779 aa  89.7  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3733  glycoside hydrolase family 20  22.25 
 
 
595 aa  89.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0925128  decreased coverage  0.00246755 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1661  glycoside hydrolase family protein  24.18 
 
 
556 aa  89.4  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0521911  hitchhiker  0.0032281 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0222  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  22.29 
 
 
571 aa  89.7  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.68 
 
 
505 aa  89  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.96 
 
 
688 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.68 
 
 
905 aa  88.2  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  24.14 
 
 
778 aa  87.8  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.11 
 
 
515 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.37 
 
 
790 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  27.58 
 
 
795 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.84 
 
 
481 aa  85.5  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3043  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.47 
 
 
589 aa  85.1  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.95 
 
 
549 aa  85.1  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.8 
 
 
655 aa  84  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.76 
 
 
533 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.87 
 
 
834 aa  83.2  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0390  Glycoside hydrolase family 20, catalytic core  27.45 
 
 
503 aa  83.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.51 
 
 
549 aa  83.2  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.17 
 
 
528 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.31 
 
 
812 aa  83.2  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.09 
 
 
422 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.92 
 
 
493 aa  82.4  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.42 
 
 
852 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  21.9 
 
 
527 aa  82.4  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  23.23 
 
 
469 aa  82  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0686  glycoside hydrolase family protein  24.66 
 
 
673 aa  81.6  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0317867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.1 
 
 
618 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  24.61 
 
 
736 aa  81.3  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.06 
 
 
766 aa  80.9  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.75 
 
 
774 aa  80.9  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  24.33 
 
 
1140 aa  80.5  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.9 
 
 
868 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.24 
 
 
534 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.11 
 
 
636 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  25.44 
 
 
614 aa  80.5  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.97 
 
 
812 aa  79.7  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0397  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.08 
 
 
722 aa  79.3  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.571244  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.91 
 
 
534 aa  79  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.49 
 
 
863 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1725  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  23.7 
 
 
758 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1424  Beta-N-acetylhexosaminidase  24.4 
 
 
643 aa  75.9  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  23.38 
 
 
820 aa  74.7  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.05 
 
 
504 aa  74.7  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  22.47 
 
 
547 aa  73.6  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>