113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32030 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  100 
 
 		 530 aa  1026    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  51.88 
 
 		 555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  51.42 
 
 		 575 aa  432  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  53.16 
 
 		 491 aa  426  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  50.51 
 
 		 555 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  48.6 
 
 		 521 aa  383  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  46.69 
 
 		 551 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  39.33 
 
 		 561 aa  277  4e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  56.39 
 
 		 558 aa  265  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  36.91 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  35.57 
 
 		 483 aa  199  9e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  33.02 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  35.1 
 
 		 476 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  32.83 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  37.44 
 
 		 489 aa  171  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  35.88 
 
 		 766 aa  170  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  33.25 
 
 		 539 aa  153  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  31.33 
 
 		 467 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  32.75 
 
 		 587 aa  116  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.35 
 
 		 486 aa  95.5  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  23.53 
 
 		 632 aa  84  0.000000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  21.53 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  21.86 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.93 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  26.96 
 
 		 540 aa  73.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  23.6 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  27.69 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  21.16 
 
 		 471 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  31.61 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.62 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  21.21 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  21.21 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  20.37 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  28.01 
 
 		 504 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.44 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  22.42 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  31.01 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  22.64 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.36 
 
 		 549 aa  64.7  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  27.68 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  21.13 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  20.36 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  25.13 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  21.49 
 
 		 480 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.31 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  37.31 
 
 		 498 aa  60.1  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  21.37 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  23.05 
 
 		 453 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  21.5 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  28.12 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  21.32 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  21.64 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  23.31 
 
 		 501 aa  57.4  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.48 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 579 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  22.81 
 
 		 504 aa  55.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  28.19 
 
 		 646 aa  55.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  39 
 
 		 183 aa  53.9  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  26.8 
 
 		 506 aa  53.9  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  29.41 
 
 		 673 aa  53.5  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  42.25 
 
 		 182 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  35.48 
 
 		 167 aa  52  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  38.1 
 
 		 174 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  28.38 
 
 		 550 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  32.91 
 
 		 169 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  29.38 
 
 		 658 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  37.5 
 
 		 171 aa  50.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  26.89 
 
 		 609 aa  50.4  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  36.67 
 
 		 165 aa  50.1  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  30.91 
 
 		 512 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  26.9 
 
 		 542 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  25.86 
 
 		 700 aa  50.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  33.73 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  34.44 
 
 		 172 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  22.06 
 
 		 483 aa  49.3  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  39.33 
 
 		 182 aa  49.3  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  28.05 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  34.57 
 
 		 165 aa  48.5  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  32.65 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  32.08 
 
 		 174 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  24.77 
 
 		 514 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  29.2 
 
 		 181 aa  48.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  24.81 
 
 		 544 aa  47.8  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  24.47 
 
 		 532 aa  47.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  37.66 
 
 		 161 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  34.69 
 
 		 170 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  24.23 
 
 		 634 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 		 522 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  29.81 
 
 		 193 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  29.73 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  32.98 
 
 		 164 aa  47  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  36.59 
 
 		 155 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  15.27 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  33.72 
 
 		 174 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  36.49 
 
 		 533 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  22.04 
 
 		 541 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  33.72 
 
 		 167 aa  45.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>